Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS55

Tnfsf18, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 18, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf18Q7TS55 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tnfsf18Q7TS55 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tnfsf18Q7TS55 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tnfsf18Q7TS55 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tnfsf18Q7TS55 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Tnfsf18Q7TS55 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tnfsf18Q7TS55 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tnfsf18Q7TS55 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tnfsf18Q7TS55 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tnfsf18Q7TS55 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tnfsf18Q7TS55 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Tnfsf18Q7TS55 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tnfsf18Q7TS55 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tnfsf18Q7TS55 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tnfsf18Q7TS55 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tnfsf18Q7TS55 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tnfsf18Q7TS55 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tnfsf18Q7TS55 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tnfsf18Q7TS55 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tnfsf18Q7TS55 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Tnfsf18Q7TS55 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tnfsf18Q7TS55 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tnfsf18Q7TS55 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tnfsf18Q7TS55 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tnfsf18Q7TS55 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tnfsf18Q7TS55 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tnfsf18Q7TS55 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tnfsf18Q7TS55 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tnfsf18Q7TS55 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tnfsf18Q7TS55 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tnfsf18Q7TS55 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tnfsf18Q7TS55 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tnfsf18Q7TS55 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tnfsf18Q7TS55 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tnfsf18Q7TS55 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tnfsf18Q7TS55 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tnfsf18Q7TS55 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tnfsf18Q7TS55 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tnfsf18Q7TS55 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Tnfsf18Q7TS55 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC16.89■□□□□ 0.3
Tnfsf18Q7TS55 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Tnfsf18Q7TS55 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Tnfsf18Q7TS55 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Tnfsf18Q7TS55 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Tnfsf18Q7TS55 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tnfsf18Q7TS55 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tnfsf18Q7TS55 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Tnfsf18Q7TS55 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tnfsf18Q7TS55 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tnfsf18Q7TS55 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tnfsf18Q7TS55 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tnfsf18Q7TS55 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tnfsf18Q7TS55 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tnfsf18Q7TS55 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tnfsf18Q7TS55 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tnfsf18Q7TS55 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tnfsf18Q7TS55 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Tnfsf18Q7TS55 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tnfsf18Q7TS55 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tnfsf18Q7TS55 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tnfsf18Q7TS55 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tnfsf18Q7TS55 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tnfsf18Q7TS55 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tnfsf18Q7TS55 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tnfsf18Q7TS55 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tnfsf18Q7TS55 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tnfsf18Q7TS55 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tnfsf18Q7TS55 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tnfsf18Q7TS55 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tnfsf18Q7TS55 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tnfsf18Q7TS55 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tnfsf18Q7TS55 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tnfsf18Q7TS55 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tnfsf18Q7TS55 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tnfsf18Q7TS55 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tnfsf18Q7TS55 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tnfsf18Q7TS55 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tnfsf18Q7TS55 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tnfsf18Q7TS55 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tnfsf18Q7TS55 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tnfsf18Q7TS55 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tnfsf18Q7TS55 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tnfsf18Q7TS55 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tnfsf18Q7TS55 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tnfsf18Q7TS55 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Tnfsf18Q7TS55 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tnfsf18Q7TS55 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tnfsf18Q7TS55 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tnfsf18Q7TS55 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tnfsf18Q7TS55 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tnfsf18Q7TS55 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tnfsf18Q7TS55 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tnfsf18Q7TS55 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tnfsf18Q7TS55 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tnfsf18Q7TS55 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tnfsf18Q7TS55 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tnfsf18Q7TS55 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tnfsf18Q7TS55 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tnfsf18Q7TS55 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tnfsf18Q7TS55 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 125.6 ms