Protein–RNA interactions for Protein: Q7TQK5

Ccdc93, Coiled-coil domain-containing protein 93, mousemouse

Predictions only

Length 629 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc93Q7TQK5 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ccdc93Q7TQK5 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ccdc93Q7TQK5 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ccdc93Q7TQK5 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ccdc93Q7TQK5 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ccdc93Q7TQK5 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Ccdc93Q7TQK5 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ccdc93Q7TQK5 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ccdc93Q7TQK5 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ccdc93Q7TQK5 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ccdc93Q7TQK5 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ccdc93Q7TQK5 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ccdc93Q7TQK5 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ccdc93Q7TQK5 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ccdc93Q7TQK5 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ccdc93Q7TQK5 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ccdc93Q7TQK5 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ccdc93Q7TQK5 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ccdc93Q7TQK5 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ccdc93Q7TQK5 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ccdc93Q7TQK5 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ccdc93Q7TQK5 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ccdc93Q7TQK5 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ccdc93Q7TQK5 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
Ccdc93Q7TQK5 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ccdc93Q7TQK5 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ccdc93Q7TQK5 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ccdc93Q7TQK5 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ccdc93Q7TQK5 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Ccdc93Q7TQK5 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Ccdc93Q7TQK5 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ccdc93Q7TQK5 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ccdc93Q7TQK5 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ccdc93Q7TQK5 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ccdc93Q7TQK5 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Ccdc93Q7TQK5 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ccdc93Q7TQK5 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Ccdc93Q7TQK5 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ccdc93Q7TQK5 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ccdc93Q7TQK5 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ccdc93Q7TQK5 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ccdc93Q7TQK5 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ccdc93Q7TQK5 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ccdc93Q7TQK5 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ccdc93Q7TQK5 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ccdc93Q7TQK5 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Ccdc93Q7TQK5 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ccdc93Q7TQK5 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ccdc93Q7TQK5 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ccdc93Q7TQK5 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ccdc93Q7TQK5 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ccdc93Q7TQK5 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ccdc93Q7TQK5 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ccdc93Q7TQK5 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ccdc93Q7TQK5 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ccdc93Q7TQK5 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ccdc93Q7TQK5 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ccdc93Q7TQK5 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ccdc93Q7TQK5 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ccdc93Q7TQK5 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ccdc93Q7TQK5 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ccdc93Q7TQK5 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ccdc93Q7TQK5 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Ccdc93Q7TQK5 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Ccdc93Q7TQK5 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ccdc93Q7TQK5 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ccdc93Q7TQK5 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ccdc93Q7TQK5 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ccdc93Q7TQK5 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ccdc93Q7TQK5 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ccdc93Q7TQK5 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ccdc93Q7TQK5 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ccdc93Q7TQK5 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ccdc93Q7TQK5 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ccdc93Q7TQK5 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ccdc93Q7TQK5 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ccdc93Q7TQK5 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Ccdc93Q7TQK5 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ccdc93Q7TQK5 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ccdc93Q7TQK5 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Ccdc93Q7TQK5 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ccdc93Q7TQK5 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ccdc93Q7TQK5 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ccdc93Q7TQK5 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ccdc93Q7TQK5 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ccdc93Q7TQK5 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ccdc93Q7TQK5 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ccdc93Q7TQK5 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ccdc93Q7TQK5 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ccdc93Q7TQK5 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ccdc93Q7TQK5 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ccdc93Q7TQK5 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ccdc93Q7TQK5 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
Ccdc93Q7TQK5 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ccdc93Q7TQK5 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ccdc93Q7TQK5 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ccdc93Q7TQK5 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ccdc93Q7TQK5 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ccdc93Q7TQK5 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ccdc93Q7TQK5 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.9 ms