Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNB8

Sbno2, Protein strawberry notch homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sbno2Q7TNB8 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Sbno2Q7TNB8 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Sbno2Q7TNB8 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Sbno2Q7TNB8 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Sbno2Q7TNB8 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Sbno2Q7TNB8 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Sbno2Q7TNB8 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Sbno2Q7TNB8 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Sbno2Q7TNB8 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Sbno2Q7TNB8 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Sbno2Q7TNB8 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Sbno2Q7TNB8 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Sbno2Q7TNB8 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Sbno2Q7TNB8 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Sbno2Q7TNB8 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Sbno2Q7TNB8 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Sbno2Q7TNB8 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Sbno2Q7TNB8 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Sbno2Q7TNB8 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
Sbno2Q7TNB8 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC25.33■■□□□ 1.64
Sbno2Q7TNB8 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
Sbno2Q7TNB8 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Sbno2Q7TNB8 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Sbno2Q7TNB8 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Sbno2Q7TNB8 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Sbno2Q7TNB8 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Sbno2Q7TNB8 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Sbno2Q7TNB8 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Sbno2Q7TNB8 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Sbno2Q7TNB8 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Sbno2Q7TNB8 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Sbno2Q7TNB8 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Sbno2Q7TNB8 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Sbno2Q7TNB8 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Sbno2Q7TNB8 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Sbno2Q7TNB8 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Sbno2Q7TNB8 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Sbno2Q7TNB8 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Sbno2Q7TNB8 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Sbno2Q7TNB8 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Sbno2Q7TNB8 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Sbno2Q7TNB8 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Sbno2Q7TNB8 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Sbno2Q7TNB8 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Sbno2Q7TNB8 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Sbno2Q7TNB8 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Sbno2Q7TNB8 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Sbno2Q7TNB8 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Sbno2Q7TNB8 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Sbno2Q7TNB8 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Sbno2Q7TNB8 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Sbno2Q7TNB8 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Sbno2Q7TNB8 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Sbno2Q7TNB8 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Sbno2Q7TNB8 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Sbno2Q7TNB8 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Sbno2Q7TNB8 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Sbno2Q7TNB8 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Sbno2Q7TNB8 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Sbno2Q7TNB8 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Sbno2Q7TNB8 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Sbno2Q7TNB8 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Sbno2Q7TNB8 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Sbno2Q7TNB8 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Sbno2Q7TNB8 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Sbno2Q7TNB8 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Sbno2Q7TNB8 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Sbno2Q7TNB8 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Sbno2Q7TNB8 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Sbno2Q7TNB8 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Sbno2Q7TNB8 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Sbno2Q7TNB8 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Sbno2Q7TNB8 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Sbno2Q7TNB8 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Sbno2Q7TNB8 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Sbno2Q7TNB8 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Sbno2Q7TNB8 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Sbno2Q7TNB8 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Sbno2Q7TNB8 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Sbno2Q7TNB8 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Sbno2Q7TNB8 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Sbno2Q7TNB8 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Sbno2Q7TNB8 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Sbno2Q7TNB8 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Sbno2Q7TNB8 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Sbno2Q7TNB8 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Sbno2Q7TNB8 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Sbno2Q7TNB8 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Sbno2Q7TNB8 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Sbno2Q7TNB8 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Sbno2Q7TNB8 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Sbno2Q7TNB8 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Sbno2Q7TNB8 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Sbno2Q7TNB8 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Sbno2Q7TNB8 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Sbno2Q7TNB8 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Sbno2Q7TNB8 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Sbno2Q7TNB8 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Sbno2Q7TNB8 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Sbno2Q7TNB8 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms