Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMK9

Syncrip, Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein Q, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SyncripQ7TMK9 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SyncripQ7TMK9 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SyncripQ7TMK9 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SyncripQ7TMK9 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SyncripQ7TMK9 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SyncripQ7TMK9 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SyncripQ7TMK9 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SyncripQ7TMK9 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SyncripQ7TMK9 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SyncripQ7TMK9 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SyncripQ7TMK9 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SyncripQ7TMK9 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SyncripQ7TMK9 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SyncripQ7TMK9 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SyncripQ7TMK9 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SyncripQ7TMK9 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SyncripQ7TMK9 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SyncripQ7TMK9 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SyncripQ7TMK9 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SyncripQ7TMK9 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SyncripQ7TMK9 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SyncripQ7TMK9 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SyncripQ7TMK9 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SyncripQ7TMK9 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SyncripQ7TMK9 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SyncripQ7TMK9 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SyncripQ7TMK9 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SyncripQ7TMK9 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SyncripQ7TMK9 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SyncripQ7TMK9 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SyncripQ7TMK9 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SyncripQ7TMK9 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SyncripQ7TMK9 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SyncripQ7TMK9 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SyncripQ7TMK9 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SyncripQ7TMK9 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SyncripQ7TMK9 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SyncripQ7TMK9 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SyncripQ7TMK9 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SyncripQ7TMK9 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SyncripQ7TMK9 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SyncripQ7TMK9 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SyncripQ7TMK9 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SyncripQ7TMK9 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SyncripQ7TMK9 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SyncripQ7TMK9 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SyncripQ7TMK9 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SyncripQ7TMK9 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SyncripQ7TMK9 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SyncripQ7TMK9 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SyncripQ7TMK9 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SyncripQ7TMK9 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SyncripQ7TMK9 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SyncripQ7TMK9 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SyncripQ7TMK9 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SyncripQ7TMK9 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SyncripQ7TMK9 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SyncripQ7TMK9 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SyncripQ7TMK9 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SyncripQ7TMK9 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SyncripQ7TMK9 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SyncripQ7TMK9 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SyncripQ7TMK9 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SyncripQ7TMK9 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SyncripQ7TMK9 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SyncripQ7TMK9 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SyncripQ7TMK9 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SyncripQ7TMK9 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SyncripQ7TMK9 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SyncripQ7TMK9 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SyncripQ7TMK9 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SyncripQ7TMK9 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SyncripQ7TMK9 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SyncripQ7TMK9 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SyncripQ7TMK9 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SyncripQ7TMK9 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SyncripQ7TMK9 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SyncripQ7TMK9 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SyncripQ7TMK9 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SyncripQ7TMK9 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SyncripQ7TMK9 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SyncripQ7TMK9 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SyncripQ7TMK9 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SyncripQ7TMK9 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SyncripQ7TMK9 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SyncripQ7TMK9 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SyncripQ7TMK9 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SyncripQ7TMK9 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SyncripQ7TMK9 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SyncripQ7TMK9 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SyncripQ7TMK9 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SyncripQ7TMK9 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SyncripQ7TMK9 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SyncripQ7TMK9 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SyncripQ7TMK9 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SyncripQ7TMK9 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SyncripQ7TMK9 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SyncripQ7TMK9 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SyncripQ7TMK9 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SyncripQ7TMK9 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms