Protein–RNA interactions for Protein: Q7M729

Scn4b, Sodium channel subunit beta-4, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn4bQ7M729 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Scn4bQ7M729 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Scn4bQ7M729 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Scn4bQ7M729 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Scn4bQ7M729 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Scn4bQ7M729 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Scn4bQ7M729 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Scn4bQ7M729 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Scn4bQ7M729 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Scn4bQ7M729 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Scn4bQ7M729 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Scn4bQ7M729 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Scn4bQ7M729 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Scn4bQ7M729 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Scn4bQ7M729 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Scn4bQ7M729 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Scn4bQ7M729 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Scn4bQ7M729 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Scn4bQ7M729 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Scn4bQ7M729 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Scn4bQ7M729 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Scn4bQ7M729 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Scn4bQ7M729 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Scn4bQ7M729 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Scn4bQ7M729 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Scn4bQ7M729 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Scn4bQ7M729 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Scn4bQ7M729 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Scn4bQ7M729 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Scn4bQ7M729 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Scn4bQ7M729 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Scn4bQ7M729 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Scn4bQ7M729 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Scn4bQ7M729 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Scn4bQ7M729 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Scn4bQ7M729 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Scn4bQ7M729 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Scn4bQ7M729 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Scn4bQ7M729 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Scn4bQ7M729 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Scn4bQ7M729 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Scn4bQ7M729 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Scn4bQ7M729 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Scn4bQ7M729 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Scn4bQ7M729 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Scn4bQ7M729 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Scn4bQ7M729 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Scn4bQ7M729 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Scn4bQ7M729 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Scn4bQ7M729 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Scn4bQ7M729 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Scn4bQ7M729 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Scn4bQ7M729 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Scn4bQ7M729 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Scn4bQ7M729 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Scn4bQ7M729 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Scn4bQ7M729 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Scn4bQ7M729 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Scn4bQ7M729 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Scn4bQ7M729 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Scn4bQ7M729 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Scn4bQ7M729 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Scn4bQ7M729 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Scn4bQ7M729 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Scn4bQ7M729 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Scn4bQ7M729 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Scn4bQ7M729 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Scn4bQ7M729 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Scn4bQ7M729 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Scn4bQ7M729 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Scn4bQ7M729 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Scn4bQ7M729 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Scn4bQ7M729 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Scn4bQ7M729 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Scn4bQ7M729 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Scn4bQ7M729 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Scn4bQ7M729 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Scn4bQ7M729 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Scn4bQ7M729 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Scn4bQ7M729 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Scn4bQ7M729 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Scn4bQ7M729 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Scn4bQ7M729 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Scn4bQ7M729 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Scn4bQ7M729 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Scn4bQ7M729 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Scn4bQ7M729 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Scn4bQ7M729 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Scn4bQ7M729 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Scn4bQ7M729 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Scn4bQ7M729 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Scn4bQ7M729 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Scn4bQ7M729 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Scn4bQ7M729 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Scn4bQ7M729 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Scn4bQ7M729 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Scn4bQ7M729 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Scn4bQ7M729 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Scn4bQ7M729 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Scn4bQ7M729 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
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