Protein–RNA interactions for Protein: Q7M6Y2

Sox11, Transcription factor SOX-11, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox11Q7M6Y2 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sox11Q7M6Y2 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sox11Q7M6Y2 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sox11Q7M6Y2 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sox11Q7M6Y2 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sox11Q7M6Y2 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sox11Q7M6Y2 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sox11Q7M6Y2 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sox11Q7M6Y2 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sox11Q7M6Y2 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sox11Q7M6Y2 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sox11Q7M6Y2 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sox11Q7M6Y2 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sox11Q7M6Y2 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sox11Q7M6Y2 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Sox11Q7M6Y2 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sox11Q7M6Y2 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sox11Q7M6Y2 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sox11Q7M6Y2 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sox11Q7M6Y2 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sox11Q7M6Y2 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sox11Q7M6Y2 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sox11Q7M6Y2 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sox11Q7M6Y2 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sox11Q7M6Y2 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sox11Q7M6Y2 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sox11Q7M6Y2 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sox11Q7M6Y2 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sox11Q7M6Y2 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sox11Q7M6Y2 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sox11Q7M6Y2 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Sox11Q7M6Y2 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sox11Q7M6Y2 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sox11Q7M6Y2 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sox11Q7M6Y2 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sox11Q7M6Y2 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Sox11Q7M6Y2 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sox11Q7M6Y2 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sox11Q7M6Y2 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Sox11Q7M6Y2 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Sox11Q7M6Y2 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sox11Q7M6Y2 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Sox11Q7M6Y2 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sox11Q7M6Y2 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sox11Q7M6Y2 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sox11Q7M6Y2 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sox11Q7M6Y2 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sox11Q7M6Y2 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sox11Q7M6Y2 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sox11Q7M6Y2 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sox11Q7M6Y2 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sox11Q7M6Y2 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Sox11Q7M6Y2 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sox11Q7M6Y2 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sox11Q7M6Y2 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sox11Q7M6Y2 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Sox11Q7M6Y2 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sox11Q7M6Y2 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Sox11Q7M6Y2 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Sox11Q7M6Y2 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sox11Q7M6Y2 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sox11Q7M6Y2 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sox11Q7M6Y2 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Sox11Q7M6Y2 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sox11Q7M6Y2 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sox11Q7M6Y2 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sox11Q7M6Y2 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Sox11Q7M6Y2 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sox11Q7M6Y2 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sox11Q7M6Y2 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sox11Q7M6Y2 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Sox11Q7M6Y2 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sox11Q7M6Y2 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sox11Q7M6Y2 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sox11Q7M6Y2 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sox11Q7M6Y2 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sox11Q7M6Y2 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sox11Q7M6Y2 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sox11Q7M6Y2 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sox11Q7M6Y2 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sox11Q7M6Y2 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sox11Q7M6Y2 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sox11Q7M6Y2 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sox11Q7M6Y2 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sox11Q7M6Y2 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Sox11Q7M6Y2 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sox11Q7M6Y2 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sox11Q7M6Y2 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sox11Q7M6Y2 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sox11Q7M6Y2 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sox11Q7M6Y2 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sox11Q7M6Y2 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sox11Q7M6Y2 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sox11Q7M6Y2 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Sox11Q7M6Y2 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sox11Q7M6Y2 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sox11Q7M6Y2 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sox11Q7M6Y2 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Sox11Q7M6Y2 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sox11Q7M6Y2 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms