Protein–RNA interactions for Protein: Q78IS1

Tmed3, Transmembrane emp24 domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed3Q78IS1 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tmed3Q78IS1 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tmed3Q78IS1 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tmed3Q78IS1 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tmed3Q78IS1 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tmed3Q78IS1 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tmed3Q78IS1 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tmed3Q78IS1 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tmed3Q78IS1 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tmed3Q78IS1 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tmed3Q78IS1 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tmed3Q78IS1 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tmed3Q78IS1 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tmed3Q78IS1 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tmed3Q78IS1 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tmed3Q78IS1 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tmed3Q78IS1 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tmed3Q78IS1 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tmed3Q78IS1 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tmed3Q78IS1 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tmed3Q78IS1 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tmed3Q78IS1 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tmed3Q78IS1 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tmed3Q78IS1 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tmed3Q78IS1 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tmed3Q78IS1 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tmed3Q78IS1 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tmed3Q78IS1 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tmed3Q78IS1 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tmed3Q78IS1 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tmed3Q78IS1 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tmed3Q78IS1 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tmed3Q78IS1 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tmed3Q78IS1 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tmed3Q78IS1 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tmed3Q78IS1 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tmed3Q78IS1 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tmed3Q78IS1 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Tmed3Q78IS1 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Tmed3Q78IS1 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tmed3Q78IS1 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tmed3Q78IS1 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tmed3Q78IS1 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tmed3Q78IS1 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tmed3Q78IS1 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tmed3Q78IS1 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tmed3Q78IS1 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tmed3Q78IS1 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tmed3Q78IS1 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tmed3Q78IS1 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Tmed3Q78IS1 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tmed3Q78IS1 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tmed3Q78IS1 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Tmed3Q78IS1 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tmed3Q78IS1 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tmed3Q78IS1 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tmed3Q78IS1 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tmed3Q78IS1 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tmed3Q78IS1 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tmed3Q78IS1 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Tmed3Q78IS1 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tmed3Q78IS1 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tmed3Q78IS1 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tmed3Q78IS1 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tmed3Q78IS1 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tmed3Q78IS1 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tmed3Q78IS1 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Tmed3Q78IS1 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tmed3Q78IS1 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tmed3Q78IS1 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tmed3Q78IS1 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tmed3Q78IS1 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Tmed3Q78IS1 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
Tmed3Q78IS1 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Tmed3Q78IS1 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Tmed3Q78IS1 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Tmed3Q78IS1 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Tmed3Q78IS1 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Tmed3Q78IS1 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tmed3Q78IS1 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tmed3Q78IS1 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Tmed3Q78IS1 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tmed3Q78IS1 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tmed3Q78IS1 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tmed3Q78IS1 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tmed3Q78IS1 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tmed3Q78IS1 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tmed3Q78IS1 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tmed3Q78IS1 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tmed3Q78IS1 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tmed3Q78IS1 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tmed3Q78IS1 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tmed3Q78IS1 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tmed3Q78IS1 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tmed3Q78IS1 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tmed3Q78IS1 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tmed3Q78IS1 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tmed3Q78IS1 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tmed3Q78IS1 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tmed3Q78IS1 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms