Protein–RNA interactions for Protein: Q6YND2

Znf653, Zinc finger protein 653, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf653Q6YND2 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Znf653Q6YND2 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Znf653Q6YND2 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Znf653Q6YND2 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Znf653Q6YND2 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Znf653Q6YND2 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Znf653Q6YND2 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Znf653Q6YND2 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Znf653Q6YND2 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Znf653Q6YND2 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Znf653Q6YND2 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Znf653Q6YND2 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Znf653Q6YND2 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Znf653Q6YND2 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Znf653Q6YND2 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Znf653Q6YND2 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Znf653Q6YND2 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Znf653Q6YND2 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Znf653Q6YND2 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Znf653Q6YND2 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Znf653Q6YND2 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Znf653Q6YND2 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Znf653Q6YND2 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Znf653Q6YND2 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Znf653Q6YND2 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Znf653Q6YND2 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Znf653Q6YND2 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Znf653Q6YND2 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Znf653Q6YND2 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Znf653Q6YND2 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Znf653Q6YND2 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Znf653Q6YND2 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Znf653Q6YND2 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Znf653Q6YND2 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Znf653Q6YND2 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Znf653Q6YND2 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Znf653Q6YND2 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Znf653Q6YND2 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Znf653Q6YND2 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Znf653Q6YND2 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Znf653Q6YND2 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Znf653Q6YND2 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Znf653Q6YND2 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Znf653Q6YND2 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Znf653Q6YND2 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Znf653Q6YND2 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Znf653Q6YND2 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Znf653Q6YND2 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Znf653Q6YND2 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Znf653Q6YND2 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Znf653Q6YND2 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Znf653Q6YND2 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Znf653Q6YND2 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Znf653Q6YND2 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Znf653Q6YND2 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Znf653Q6YND2 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Znf653Q6YND2 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Znf653Q6YND2 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Znf653Q6YND2 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Znf653Q6YND2 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Znf653Q6YND2 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Znf653Q6YND2 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Znf653Q6YND2 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Znf653Q6YND2 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Znf653Q6YND2 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Znf653Q6YND2 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Znf653Q6YND2 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Znf653Q6YND2 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Znf653Q6YND2 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Znf653Q6YND2 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Znf653Q6YND2 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Znf653Q6YND2 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Znf653Q6YND2 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Znf653Q6YND2 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Znf653Q6YND2 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Znf653Q6YND2 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Znf653Q6YND2 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Znf653Q6YND2 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Znf653Q6YND2 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Znf653Q6YND2 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Znf653Q6YND2 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Znf653Q6YND2 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Znf653Q6YND2 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Znf653Q6YND2 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Znf653Q6YND2 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Znf653Q6YND2 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Znf653Q6YND2 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Znf653Q6YND2 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Znf653Q6YND2 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Znf653Q6YND2 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Znf653Q6YND2 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Znf653Q6YND2 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Znf653Q6YND2 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Znf653Q6YND2 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Znf653Q6YND2 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Znf653Q6YND2 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Znf653Q6YND2 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Znf653Q6YND2 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Znf653Q6YND2 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Znf653Q6YND2 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms