Protein–RNA interactions for Protein: Q6S5G4

Gja6, Gap junction alpha-6 protein, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja6Q6S5G4 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gja6Q6S5G4 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Gja6Q6S5G4 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Gja6Q6S5G4 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gja6Q6S5G4 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gja6Q6S5G4 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gja6Q6S5G4 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gja6Q6S5G4 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gja6Q6S5G4 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gja6Q6S5G4 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gja6Q6S5G4 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gja6Q6S5G4 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gja6Q6S5G4 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gja6Q6S5G4 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gja6Q6S5G4 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gja6Q6S5G4 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gja6Q6S5G4 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gja6Q6S5G4 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gja6Q6S5G4 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Gja6Q6S5G4 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gja6Q6S5G4 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Gja6Q6S5G4 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Gja6Q6S5G4 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Gja6Q6S5G4 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Gja6Q6S5G4 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gja6Q6S5G4 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gja6Q6S5G4 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gja6Q6S5G4 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gja6Q6S5G4 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gja6Q6S5G4 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gja6Q6S5G4 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gja6Q6S5G4 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gja6Q6S5G4 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gja6Q6S5G4 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gja6Q6S5G4 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gja6Q6S5G4 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gja6Q6S5G4 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gja6Q6S5G4 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gja6Q6S5G4 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gja6Q6S5G4 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gja6Q6S5G4 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gja6Q6S5G4 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Gja6Q6S5G4 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gja6Q6S5G4 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Gja6Q6S5G4 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Gja6Q6S5G4 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Gja6Q6S5G4 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Gja6Q6S5G4 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gja6Q6S5G4 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gja6Q6S5G4 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gja6Q6S5G4 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gja6Q6S5G4 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gja6Q6S5G4 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gja6Q6S5G4 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gja6Q6S5G4 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gja6Q6S5G4 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Gja6Q6S5G4 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gja6Q6S5G4 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gja6Q6S5G4 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Gja6Q6S5G4 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gja6Q6S5G4 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gja6Q6S5G4 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gja6Q6S5G4 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gja6Q6S5G4 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gja6Q6S5G4 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gja6Q6S5G4 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Gja6Q6S5G4 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Gja6Q6S5G4 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Gja6Q6S5G4 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Gja6Q6S5G4 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Gja6Q6S5G4 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Gja6Q6S5G4 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gja6Q6S5G4 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gja6Q6S5G4 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Gja6Q6S5G4 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gja6Q6S5G4 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gja6Q6S5G4 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gja6Q6S5G4 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gja6Q6S5G4 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gja6Q6S5G4 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gja6Q6S5G4 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gja6Q6S5G4 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gja6Q6S5G4 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gja6Q6S5G4 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gja6Q6S5G4 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gja6Q6S5G4 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gja6Q6S5G4 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gja6Q6S5G4 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Gja6Q6S5G4 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gja6Q6S5G4 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gja6Q6S5G4 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gja6Q6S5G4 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gja6Q6S5G4 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gja6Q6S5G4 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gja6Q6S5G4 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gja6Q6S5G4 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gja6Q6S5G4 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gja6Q6S5G4 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gja6Q6S5G4 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gja6Q6S5G4 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms