Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHP6

Lrrn2, Leucine rich repeat protein 2, neuronal, isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 730 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrn2Q6PHP6 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Lrrn2Q6PHP6 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Lrrn2Q6PHP6 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Lrrn2Q6PHP6 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Lrrn2Q6PHP6 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Lrrn2Q6PHP6 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Lrrn2Q6PHP6 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Lrrn2Q6PHP6 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Lrrn2Q6PHP6 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Lrrn2Q6PHP6 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Lrrn2Q6PHP6 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Lrrn2Q6PHP6 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Lrrn2Q6PHP6 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Lrrn2Q6PHP6 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Lrrn2Q6PHP6 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Lrrn2Q6PHP6 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Lrrn2Q6PHP6 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Lrrn2Q6PHP6 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Lrrn2Q6PHP6 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Lrrn2Q6PHP6 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Lrrn2Q6PHP6 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Lrrn2Q6PHP6 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Lrrn2Q6PHP6 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Lrrn2Q6PHP6 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Lrrn2Q6PHP6 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Lrrn2Q6PHP6 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Lrrn2Q6PHP6 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Lrrn2Q6PHP6 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Lrrn2Q6PHP6 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Lrrn2Q6PHP6 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Lrrn2Q6PHP6 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Lrrn2Q6PHP6 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Lrrn2Q6PHP6 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Lrrn2Q6PHP6 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Lrrn2Q6PHP6 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Lrrn2Q6PHP6 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Lrrn2Q6PHP6 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Lrrn2Q6PHP6 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Lrrn2Q6PHP6 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Lrrn2Q6PHP6 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Lrrn2Q6PHP6 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Lrrn2Q6PHP6 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Lrrn2Q6PHP6 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Lrrn2Q6PHP6 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Lrrn2Q6PHP6 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Lrrn2Q6PHP6 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Lrrn2Q6PHP6 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Lrrn2Q6PHP6 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Lrrn2Q6PHP6 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Lrrn2Q6PHP6 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Lrrn2Q6PHP6 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Lrrn2Q6PHP6 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Lrrn2Q6PHP6 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Lrrn2Q6PHP6 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Lrrn2Q6PHP6 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Lrrn2Q6PHP6 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Lrrn2Q6PHP6 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Lrrn2Q6PHP6 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Lrrn2Q6PHP6 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Lrrn2Q6PHP6 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Lrrn2Q6PHP6 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Lrrn2Q6PHP6 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Lrrn2Q6PHP6 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Lrrn2Q6PHP6 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Lrrn2Q6PHP6 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Lrrn2Q6PHP6 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Lrrn2Q6PHP6 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Lrrn2Q6PHP6 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Lrrn2Q6PHP6 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Lrrn2Q6PHP6 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Lrrn2Q6PHP6 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Lrrn2Q6PHP6 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Lrrn2Q6PHP6 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Lrrn2Q6PHP6 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Lrrn2Q6PHP6 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Lrrn2Q6PHP6 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Lrrn2Q6PHP6 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Lrrn2Q6PHP6 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Lrrn2Q6PHP6 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Lrrn2Q6PHP6 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Lrrn2Q6PHP6 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Lrrn2Q6PHP6 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Lrrn2Q6PHP6 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Lrrn2Q6PHP6 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Lrrn2Q6PHP6 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Lrrn2Q6PHP6 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Lrrn2Q6PHP6 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Lrrn2Q6PHP6 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Lrrn2Q6PHP6 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Lrrn2Q6PHP6 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Lrrn2Q6PHP6 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Lrrn2Q6PHP6 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Lrrn2Q6PHP6 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Lrrn2Q6PHP6 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Lrrn2Q6PHP6 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Lrrn2Q6PHP6 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Lrrn2Q6PHP6 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Lrrn2Q6PHP6 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Lrrn2Q6PHP6 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Lrrn2Q6PHP6 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms