Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFQ7

Rasa4, Ras GTPase-activating protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 802 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rasa4Q6PFQ7 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rasa4Q6PFQ7 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Rasa4Q6PFQ7 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Rasa4Q6PFQ7 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Rasa4Q6PFQ7 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rasa4Q6PFQ7 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rasa4Q6PFQ7 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rasa4Q6PFQ7 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rasa4Q6PFQ7 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rasa4Q6PFQ7 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Rasa4Q6PFQ7 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rasa4Q6PFQ7 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rasa4Q6PFQ7 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rasa4Q6PFQ7 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rasa4Q6PFQ7 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rasa4Q6PFQ7 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rasa4Q6PFQ7 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rasa4Q6PFQ7 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rasa4Q6PFQ7 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Rasa4Q6PFQ7 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rasa4Q6PFQ7 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rasa4Q6PFQ7 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rasa4Q6PFQ7 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rasa4Q6PFQ7 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rasa4Q6PFQ7 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rasa4Q6PFQ7 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rasa4Q6PFQ7 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rasa4Q6PFQ7 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rasa4Q6PFQ7 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rasa4Q6PFQ7 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rasa4Q6PFQ7 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rasa4Q6PFQ7 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rasa4Q6PFQ7 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rasa4Q6PFQ7 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rasa4Q6PFQ7 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rasa4Q6PFQ7 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rasa4Q6PFQ7 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rasa4Q6PFQ7 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rasa4Q6PFQ7 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rasa4Q6PFQ7 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rasa4Q6PFQ7 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Rasa4Q6PFQ7 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Rasa4Q6PFQ7 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rasa4Q6PFQ7 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rasa4Q6PFQ7 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rasa4Q6PFQ7 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rasa4Q6PFQ7 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rasa4Q6PFQ7 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rasa4Q6PFQ7 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rasa4Q6PFQ7 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rasa4Q6PFQ7 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rasa4Q6PFQ7 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rasa4Q6PFQ7 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rasa4Q6PFQ7 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rasa4Q6PFQ7 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rasa4Q6PFQ7 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rasa4Q6PFQ7 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rasa4Q6PFQ7 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rasa4Q6PFQ7 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rasa4Q6PFQ7 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rasa4Q6PFQ7 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Rasa4Q6PFQ7 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Rasa4Q6PFQ7 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rasa4Q6PFQ7 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rasa4Q6PFQ7 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rasa4Q6PFQ7 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Rasa4Q6PFQ7 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rasa4Q6PFQ7 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rasa4Q6PFQ7 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rasa4Q6PFQ7 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rasa4Q6PFQ7 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rasa4Q6PFQ7 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rasa4Q6PFQ7 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Rasa4Q6PFQ7 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
Rasa4Q6PFQ7 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Rasa4Q6PFQ7 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rasa4Q6PFQ7 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rasa4Q6PFQ7 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rasa4Q6PFQ7 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rasa4Q6PFQ7 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rasa4Q6PFQ7 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rasa4Q6PFQ7 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rasa4Q6PFQ7 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rasa4Q6PFQ7 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rasa4Q6PFQ7 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rasa4Q6PFQ7 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rasa4Q6PFQ7 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rasa4Q6PFQ7 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rasa4Q6PFQ7 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rasa4Q6PFQ7 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rasa4Q6PFQ7 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rasa4Q6PFQ7 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rasa4Q6PFQ7 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rasa4Q6PFQ7 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rasa4Q6PFQ7 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rasa4Q6PFQ7 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rasa4Q6PFQ7 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rasa4Q6PFQ7 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rasa4Q6PFQ7 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rasa4Q6PFQ7 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.8 ms