Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDF3

Svopl, Putative transporter SVOPL, mousemouse

Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SvoplQ6PDF3 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SvoplQ6PDF3 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SvoplQ6PDF3 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SvoplQ6PDF3 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SvoplQ6PDF3 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SvoplQ6PDF3 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SvoplQ6PDF3 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SvoplQ6PDF3 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SvoplQ6PDF3 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SvoplQ6PDF3 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SvoplQ6PDF3 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SvoplQ6PDF3 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SvoplQ6PDF3 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SvoplQ6PDF3 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SvoplQ6PDF3 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SvoplQ6PDF3 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SvoplQ6PDF3 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SvoplQ6PDF3 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SvoplQ6PDF3 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SvoplQ6PDF3 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SvoplQ6PDF3 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SvoplQ6PDF3 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SvoplQ6PDF3 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SvoplQ6PDF3 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SvoplQ6PDF3 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SvoplQ6PDF3 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SvoplQ6PDF3 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
SvoplQ6PDF3 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SvoplQ6PDF3 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SvoplQ6PDF3 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SvoplQ6PDF3 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SvoplQ6PDF3 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SvoplQ6PDF3 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SvoplQ6PDF3 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SvoplQ6PDF3 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SvoplQ6PDF3 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SvoplQ6PDF3 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SvoplQ6PDF3 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SvoplQ6PDF3 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SvoplQ6PDF3 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SvoplQ6PDF3 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SvoplQ6PDF3 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SvoplQ6PDF3 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SvoplQ6PDF3 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SvoplQ6PDF3 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SvoplQ6PDF3 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SvoplQ6PDF3 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SvoplQ6PDF3 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SvoplQ6PDF3 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SvoplQ6PDF3 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
SvoplQ6PDF3 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
SvoplQ6PDF3 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SvoplQ6PDF3 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SvoplQ6PDF3 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SvoplQ6PDF3 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SvoplQ6PDF3 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SvoplQ6PDF3 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SvoplQ6PDF3 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SvoplQ6PDF3 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SvoplQ6PDF3 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SvoplQ6PDF3 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
SvoplQ6PDF3 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SvoplQ6PDF3 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SvoplQ6PDF3 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SvoplQ6PDF3 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SvoplQ6PDF3 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SvoplQ6PDF3 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SvoplQ6PDF3 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SvoplQ6PDF3 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SvoplQ6PDF3 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SvoplQ6PDF3 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SvoplQ6PDF3 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SvoplQ6PDF3 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
SvoplQ6PDF3 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SvoplQ6PDF3 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SvoplQ6PDF3 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SvoplQ6PDF3 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SvoplQ6PDF3 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SvoplQ6PDF3 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SvoplQ6PDF3 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SvoplQ6PDF3 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SvoplQ6PDF3 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SvoplQ6PDF3 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SvoplQ6PDF3 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SvoplQ6PDF3 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SvoplQ6PDF3 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SvoplQ6PDF3 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SvoplQ6PDF3 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SvoplQ6PDF3 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SvoplQ6PDF3 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SvoplQ6PDF3 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SvoplQ6PDF3 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SvoplQ6PDF3 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SvoplQ6PDF3 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SvoplQ6PDF3 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SvoplQ6PDF3 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SvoplQ6PDF3 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SvoplQ6PDF3 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SvoplQ6PDF3 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SvoplQ6PDF3 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms