Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9S1

Atmin, ATM interactor, mousemouse

Predictions only

Length 818 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtminQ6P9S1 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
AtminQ6P9S1 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
AtminQ6P9S1 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
AtminQ6P9S1 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
AtminQ6P9S1 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
AtminQ6P9S1 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
AtminQ6P9S1 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
AtminQ6P9S1 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
AtminQ6P9S1 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
AtminQ6P9S1 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
AtminQ6P9S1 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
AtminQ6P9S1 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
AtminQ6P9S1 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
AtminQ6P9S1 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
AtminQ6P9S1 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
AtminQ6P9S1 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
AtminQ6P9S1 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
AtminQ6P9S1 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
AtminQ6P9S1 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
AtminQ6P9S1 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
AtminQ6P9S1 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
AtminQ6P9S1 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
AtminQ6P9S1 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
AtminQ6P9S1 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
AtminQ6P9S1 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
AtminQ6P9S1 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
AtminQ6P9S1 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
AtminQ6P9S1 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
AtminQ6P9S1 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
AtminQ6P9S1 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
AtminQ6P9S1 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
AtminQ6P9S1 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
AtminQ6P9S1 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
AtminQ6P9S1 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
AtminQ6P9S1 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
AtminQ6P9S1 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
AtminQ6P9S1 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
AtminQ6P9S1 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
AtminQ6P9S1 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
AtminQ6P9S1 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
AtminQ6P9S1 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
AtminQ6P9S1 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
AtminQ6P9S1 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
AtminQ6P9S1 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
AtminQ6P9S1 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
AtminQ6P9S1 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
AtminQ6P9S1 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
AtminQ6P9S1 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
AtminQ6P9S1 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
AtminQ6P9S1 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
AtminQ6P9S1 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
AtminQ6P9S1 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
AtminQ6P9S1 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
AtminQ6P9S1 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
AtminQ6P9S1 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
AtminQ6P9S1 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
AtminQ6P9S1 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
AtminQ6P9S1 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
AtminQ6P9S1 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
AtminQ6P9S1 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
AtminQ6P9S1 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
AtminQ6P9S1 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
AtminQ6P9S1 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
AtminQ6P9S1 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
AtminQ6P9S1 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
AtminQ6P9S1 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
AtminQ6P9S1 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
AtminQ6P9S1 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
AtminQ6P9S1 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
AtminQ6P9S1 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
AtminQ6P9S1 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
AtminQ6P9S1 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
AtminQ6P9S1 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
AtminQ6P9S1 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
AtminQ6P9S1 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
AtminQ6P9S1 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
AtminQ6P9S1 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
AtminQ6P9S1 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
AtminQ6P9S1 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
AtminQ6P9S1 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
AtminQ6P9S1 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
AtminQ6P9S1 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
AtminQ6P9S1 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
AtminQ6P9S1 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
AtminQ6P9S1 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
AtminQ6P9S1 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
AtminQ6P9S1 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
AtminQ6P9S1 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
AtminQ6P9S1 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
AtminQ6P9S1 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
AtminQ6P9S1 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
AtminQ6P9S1 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
AtminQ6P9S1 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
AtminQ6P9S1 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
AtminQ6P9S1 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
AtminQ6P9S1 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23■■□□□ 1.27
AtminQ6P9S1 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
AtminQ6P9S1 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
AtminQ6P9S1 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
AtminQ6P9S1 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 109.3 ms