Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5H2

Nes, Nestin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,864 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NesQ6P5H2 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NesQ6P5H2 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NesQ6P5H2 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NesQ6P5H2 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
NesQ6P5H2 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NesQ6P5H2 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NesQ6P5H2 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NesQ6P5H2 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NesQ6P5H2 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
NesQ6P5H2 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
NesQ6P5H2 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NesQ6P5H2 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
NesQ6P5H2 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NesQ6P5H2 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NesQ6P5H2 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NesQ6P5H2 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NesQ6P5H2 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NesQ6P5H2 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NesQ6P5H2 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NesQ6P5H2 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NesQ6P5H2 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NesQ6P5H2 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NesQ6P5H2 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NesQ6P5H2 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NesQ6P5H2 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NesQ6P5H2 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NesQ6P5H2 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NesQ6P5H2 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NesQ6P5H2 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
NesQ6P5H2 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
NesQ6P5H2 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NesQ6P5H2 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
NesQ6P5H2 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NesQ6P5H2 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NesQ6P5H2 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NesQ6P5H2 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NesQ6P5H2 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NesQ6P5H2 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NesQ6P5H2 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NesQ6P5H2 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NesQ6P5H2 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NesQ6P5H2 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NesQ6P5H2 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NesQ6P5H2 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NesQ6P5H2 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NesQ6P5H2 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NesQ6P5H2 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NesQ6P5H2 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NesQ6P5H2 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
NesQ6P5H2 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
NesQ6P5H2 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
NesQ6P5H2 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
NesQ6P5H2 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NesQ6P5H2 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NesQ6P5H2 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NesQ6P5H2 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NesQ6P5H2 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NesQ6P5H2 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NesQ6P5H2 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
NesQ6P5H2 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NesQ6P5H2 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NesQ6P5H2 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
NesQ6P5H2 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
NesQ6P5H2 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
NesQ6P5H2 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
NesQ6P5H2 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NesQ6P5H2 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
NesQ6P5H2 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
NesQ6P5H2 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NesQ6P5H2 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
NesQ6P5H2 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
NesQ6P5H2 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NesQ6P5H2 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
NesQ6P5H2 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NesQ6P5H2 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NesQ6P5H2 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NesQ6P5H2 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NesQ6P5H2 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NesQ6P5H2 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NesQ6P5H2 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NesQ6P5H2 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NesQ6P5H2 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NesQ6P5H2 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
NesQ6P5H2 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NesQ6P5H2 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
NesQ6P5H2 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
NesQ6P5H2 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NesQ6P5H2 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
NesQ6P5H2 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC26.51■■□□□ 1.84
NesQ6P5H2 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NesQ6P5H2 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NesQ6P5H2 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
NesQ6P5H2 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NesQ6P5H2 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NesQ6P5H2 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NesQ6P5H2 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NesQ6P5H2 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NesQ6P5H2 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NesQ6P5H2 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NesQ6P5H2 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.2 ms