Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1D7

Slx4, Structure-specific endonuclease subunit SLX4, mousemouse

Predictions only

Length 1,565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slx4Q6P1D7 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
Slx4Q6P1D7 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
Slx4Q6P1D7 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
Slx4Q6P1D7 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC35.98■■■■□ 3.35
Slx4Q6P1D7 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
Slx4Q6P1D7 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
Slx4Q6P1D7 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
Slx4Q6P1D7 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
Slx4Q6P1D7 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
Slx4Q6P1D7 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.93■■■■□ 3.34
Slx4Q6P1D7 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
Slx4Q6P1D7 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.93■■■■□ 3.34
Slx4Q6P1D7 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC35.93■■■■□ 3.34
Slx4Q6P1D7 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC35.93■■■■□ 3.34
Slx4Q6P1D7 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
Slx4Q6P1D7 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
Slx4Q6P1D7 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
Slx4Q6P1D7 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC35.92■■■■□ 3.34
Slx4Q6P1D7 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC35.92■■■■□ 3.34
Slx4Q6P1D7 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.91■■■■□ 3.34
Slx4Q6P1D7 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.9■■■■□ 3.34
Slx4Q6P1D7 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.9■■■■□ 3.34
Slx4Q6P1D7 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
Slx4Q6P1D7 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC35.9■■■■□ 3.34
Slx4Q6P1D7 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
Slx4Q6P1D7 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
Slx4Q6P1D7 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
Slx4Q6P1D7 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
Slx4Q6P1D7 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
Slx4Q6P1D7 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.87■■■■□ 3.33
Slx4Q6P1D7 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC35.86■■■■□ 3.33
Slx4Q6P1D7 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC35.86■■■■□ 3.33
Slx4Q6P1D7 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
Slx4Q6P1D7 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC35.85■■■■□ 3.33
Slx4Q6P1D7 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.85■■■■□ 3.33
Slx4Q6P1D7 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
Slx4Q6P1D7 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
Slx4Q6P1D7 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
Slx4Q6P1D7 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
Slx4Q6P1D7 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC35.81■■■■□ 3.32
Slx4Q6P1D7 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
Slx4Q6P1D7 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
Slx4Q6P1D7 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC35.79■■■■□ 3.32
Slx4Q6P1D7 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
Slx4Q6P1D7 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC35.79■■■■□ 3.32
Slx4Q6P1D7 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC35.78■■■■□ 3.32
Slx4Q6P1D7 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.78■■■■□ 3.32
Slx4Q6P1D7 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
Slx4Q6P1D7 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.77■■■■□ 3.32
Slx4Q6P1D7 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
Slx4Q6P1D7 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
Slx4Q6P1D7 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC35.77■■■■□ 3.32
Slx4Q6P1D7 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
Slx4Q6P1D7 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
Slx4Q6P1D7 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC35.76■■■■□ 3.32
Slx4Q6P1D7 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.76■■■■□ 3.31
Slx4Q6P1D7 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC35.75■■■■□ 3.31
Slx4Q6P1D7 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
Slx4Q6P1D7 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
Slx4Q6P1D7 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
Slx4Q6P1D7 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
Slx4Q6P1D7 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
Slx4Q6P1D7 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
Slx4Q6P1D7 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
Slx4Q6P1D7 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
Slx4Q6P1D7 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC35.71■■■■□ 3.31
Slx4Q6P1D7 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC35.7■■■■□ 3.31
Slx4Q6P1D7 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
Slx4Q6P1D7 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
Slx4Q6P1D7 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
Slx4Q6P1D7 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
Slx4Q6P1D7 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC35.68■■■■□ 3.3
Slx4Q6P1D7 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
Slx4Q6P1D7 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC35.67■■■■□ 3.3
Slx4Q6P1D7 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
Slx4Q6P1D7 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
Slx4Q6P1D7 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.66■■■■□ 3.3
Slx4Q6P1D7 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC35.65■■■■□ 3.3
Slx4Q6P1D7 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
Slx4Q6P1D7 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.64■■■■□ 3.3
Slx4Q6P1D7 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
Slx4Q6P1D7 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.64■■■■□ 3.3
Slx4Q6P1D7 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
Slx4Q6P1D7 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
Slx4Q6P1D7 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
Slx4Q6P1D7 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC35.64■■■■□ 3.3
Slx4Q6P1D7 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC35.63■■■■□ 3.29
Slx4Q6P1D7 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
Slx4Q6P1D7 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
Slx4Q6P1D7 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
Slx4Q6P1D7 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
Slx4Q6P1D7 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
Slx4Q6P1D7 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
Slx4Q6P1D7 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC35.61■■■■□ 3.29
Slx4Q6P1D7 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC35.61■■■■□ 3.29
Slx4Q6P1D7 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
Slx4Q6P1D7 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.61■■■■□ 3.29
Slx4Q6P1D7 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC35.59■■■■□ 3.29
Slx4Q6P1D7 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC35.59■■■■□ 3.29
Slx4Q6P1D7 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.58■■■■□ 3.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.7 ms