Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZM9

Hdac4, Histone deacetylase 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,076 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac4Q6NZM9 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Hdac4Q6NZM9 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Hdac4Q6NZM9 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Hdac4Q6NZM9 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Hdac4Q6NZM9 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Hdac4Q6NZM9 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Hdac4Q6NZM9 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Hdac4Q6NZM9 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Hdac4Q6NZM9 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Hdac4Q6NZM9 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Hdac4Q6NZM9 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Hdac4Q6NZM9 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Hdac4Q6NZM9 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Hdac4Q6NZM9 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Hdac4Q6NZM9 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Hdac4Q6NZM9 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Hdac4Q6NZM9 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Hdac4Q6NZM9 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Hdac4Q6NZM9 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Hdac4Q6NZM9 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Hdac4Q6NZM9 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Hdac4Q6NZM9 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Hdac4Q6NZM9 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Hdac4Q6NZM9 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Hdac4Q6NZM9 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Hdac4Q6NZM9 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Hdac4Q6NZM9 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Hdac4Q6NZM9 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Hdac4Q6NZM9 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Hdac4Q6NZM9 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Hdac4Q6NZM9 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Hdac4Q6NZM9 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Hdac4Q6NZM9 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Hdac4Q6NZM9 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Hdac4Q6NZM9 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Hdac4Q6NZM9 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Hdac4Q6NZM9 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Hdac4Q6NZM9 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Hdac4Q6NZM9 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Hdac4Q6NZM9 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Hdac4Q6NZM9 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Hdac4Q6NZM9 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Hdac4Q6NZM9 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Hdac4Q6NZM9 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Hdac4Q6NZM9 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Hdac4Q6NZM9 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Hdac4Q6NZM9 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Hdac4Q6NZM9 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Hdac4Q6NZM9 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Hdac4Q6NZM9 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Hdac4Q6NZM9 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Hdac4Q6NZM9 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Hdac4Q6NZM9 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Hdac4Q6NZM9 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Hdac4Q6NZM9 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Hdac4Q6NZM9 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Hdac4Q6NZM9 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Hdac4Q6NZM9 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Hdac4Q6NZM9 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Hdac4Q6NZM9 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Hdac4Q6NZM9 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Hdac4Q6NZM9 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Hdac4Q6NZM9 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Hdac4Q6NZM9 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Hdac4Q6NZM9 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Hdac4Q6NZM9 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Hdac4Q6NZM9 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Hdac4Q6NZM9 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Hdac4Q6NZM9 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Hdac4Q6NZM9 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Hdac4Q6NZM9 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Hdac4Q6NZM9 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Hdac4Q6NZM9 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Hdac4Q6NZM9 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Hdac4Q6NZM9 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Hdac4Q6NZM9 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Hdac4Q6NZM9 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Hdac4Q6NZM9 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Hdac4Q6NZM9 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Hdac4Q6NZM9 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Hdac4Q6NZM9 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Hdac4Q6NZM9 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Hdac4Q6NZM9 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Hdac4Q6NZM9 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Hdac4Q6NZM9 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Hdac4Q6NZM9 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Hdac4Q6NZM9 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Hdac4Q6NZM9 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Hdac4Q6NZM9 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Hdac4Q6NZM9 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Hdac4Q6NZM9 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Hdac4Q6NZM9 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Hdac4Q6NZM9 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Hdac4Q6NZM9 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Hdac4Q6NZM9 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Hdac4Q6NZM9 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Hdac4Q6NZM9 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Hdac4Q6NZM9 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Hdac4Q6NZM9 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Hdac4Q6NZM9 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms