Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSU2

2810408A11Rik, RIKEN cDNA 2810408A11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2810408A11RikQ6NSU2 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
2810408A11RikQ6NSU2 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
2810408A11RikQ6NSU2 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
2810408A11RikQ6NSU2 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
2810408A11RikQ6NSU2 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
2810408A11RikQ6NSU2 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
2810408A11RikQ6NSU2 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
2810408A11RikQ6NSU2 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
2810408A11RikQ6NSU2 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
2810408A11RikQ6NSU2 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
2810408A11RikQ6NSU2 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
2810408A11RikQ6NSU2 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
2810408A11RikQ6NSU2 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
2810408A11RikQ6NSU2 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
2810408A11RikQ6NSU2 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
2810408A11RikQ6NSU2 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
2810408A11RikQ6NSU2 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
2810408A11RikQ6NSU2 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
2810408A11RikQ6NSU2 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
2810408A11RikQ6NSU2 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
2810408A11RikQ6NSU2 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
2810408A11RikQ6NSU2 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
2810408A11RikQ6NSU2 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
2810408A11RikQ6NSU2 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
2810408A11RikQ6NSU2 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
2810408A11RikQ6NSU2 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
2810408A11RikQ6NSU2 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
2810408A11RikQ6NSU2 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
2810408A11RikQ6NSU2 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
2810408A11RikQ6NSU2 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
2810408A11RikQ6NSU2 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
2810408A11RikQ6NSU2 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
2810408A11RikQ6NSU2 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
2810408A11RikQ6NSU2 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
2810408A11RikQ6NSU2 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
2810408A11RikQ6NSU2 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
2810408A11RikQ6NSU2 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
2810408A11RikQ6NSU2 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
2810408A11RikQ6NSU2 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
2810408A11RikQ6NSU2 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
2810408A11RikQ6NSU2 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
2810408A11RikQ6NSU2 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
2810408A11RikQ6NSU2 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
2810408A11RikQ6NSU2 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
2810408A11RikQ6NSU2 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
2810408A11RikQ6NSU2 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
2810408A11RikQ6NSU2 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
2810408A11RikQ6NSU2 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
2810408A11RikQ6NSU2 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
2810408A11RikQ6NSU2 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
2810408A11RikQ6NSU2 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
2810408A11RikQ6NSU2 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
2810408A11RikQ6NSU2 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
2810408A11RikQ6NSU2 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
2810408A11RikQ6NSU2 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
2810408A11RikQ6NSU2 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
2810408A11RikQ6NSU2 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
2810408A11RikQ6NSU2 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
2810408A11RikQ6NSU2 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
2810408A11RikQ6NSU2 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
2810408A11RikQ6NSU2 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
2810408A11RikQ6NSU2 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
2810408A11RikQ6NSU2 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
2810408A11RikQ6NSU2 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
2810408A11RikQ6NSU2 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
2810408A11RikQ6NSU2 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
2810408A11RikQ6NSU2 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
2810408A11RikQ6NSU2 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
2810408A11RikQ6NSU2 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
2810408A11RikQ6NSU2 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
2810408A11RikQ6NSU2 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
2810408A11RikQ6NSU2 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
2810408A11RikQ6NSU2 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
2810408A11RikQ6NSU2 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
2810408A11RikQ6NSU2 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
2810408A11RikQ6NSU2 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
2810408A11RikQ6NSU2 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
2810408A11RikQ6NSU2 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
2810408A11RikQ6NSU2 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
2810408A11RikQ6NSU2 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
2810408A11RikQ6NSU2 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
2810408A11RikQ6NSU2 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
2810408A11RikQ6NSU2 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
2810408A11RikQ6NSU2 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
2810408A11RikQ6NSU2 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
2810408A11RikQ6NSU2 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
2810408A11RikQ6NSU2 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
2810408A11RikQ6NSU2 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
2810408A11RikQ6NSU2 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
2810408A11RikQ6NSU2 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
2810408A11RikQ6NSU2 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
2810408A11RikQ6NSU2 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
2810408A11RikQ6NSU2 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
2810408A11RikQ6NSU2 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
2810408A11RikQ6NSU2 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
2810408A11RikQ6NSU2 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
2810408A11RikQ6NSU2 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
2810408A11RikQ6NSU2 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
2810408A11RikQ6NSU2 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
2810408A11RikQ6NSU2 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms