Protein–RNA interactions for Protein: Q6A0D4

Rftn1, Raftlin, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rftn1Q6A0D4 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Rftn1Q6A0D4 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rftn1Q6A0D4 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rftn1Q6A0D4 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rftn1Q6A0D4 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rftn1Q6A0D4 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Rftn1Q6A0D4 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Rftn1Q6A0D4 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rftn1Q6A0D4 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rftn1Q6A0D4 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rftn1Q6A0D4 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rftn1Q6A0D4 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rftn1Q6A0D4 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rftn1Q6A0D4 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Rftn1Q6A0D4 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rftn1Q6A0D4 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rftn1Q6A0D4 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rftn1Q6A0D4 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rftn1Q6A0D4 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rftn1Q6A0D4 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rftn1Q6A0D4 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rftn1Q6A0D4 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rftn1Q6A0D4 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rftn1Q6A0D4 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Rftn1Q6A0D4 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rftn1Q6A0D4 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rftn1Q6A0D4 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rftn1Q6A0D4 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rftn1Q6A0D4 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rftn1Q6A0D4 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rftn1Q6A0D4 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rftn1Q6A0D4 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Rftn1Q6A0D4 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rftn1Q6A0D4 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rftn1Q6A0D4 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rftn1Q6A0D4 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rftn1Q6A0D4 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rftn1Q6A0D4 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rftn1Q6A0D4 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rftn1Q6A0D4 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rftn1Q6A0D4 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Rftn1Q6A0D4 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rftn1Q6A0D4 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rftn1Q6A0D4 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rftn1Q6A0D4 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rftn1Q6A0D4 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rftn1Q6A0D4 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rftn1Q6A0D4 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Rftn1Q6A0D4 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rftn1Q6A0D4 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rftn1Q6A0D4 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rftn1Q6A0D4 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rftn1Q6A0D4 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rftn1Q6A0D4 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rftn1Q6A0D4 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rftn1Q6A0D4 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rftn1Q6A0D4 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rftn1Q6A0D4 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rftn1Q6A0D4 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rftn1Q6A0D4 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rftn1Q6A0D4 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rftn1Q6A0D4 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rftn1Q6A0D4 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rftn1Q6A0D4 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Rftn1Q6A0D4 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rftn1Q6A0D4 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rftn1Q6A0D4 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rftn1Q6A0D4 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rftn1Q6A0D4 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rftn1Q6A0D4 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rftn1Q6A0D4 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rftn1Q6A0D4 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Rftn1Q6A0D4 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rftn1Q6A0D4 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rftn1Q6A0D4 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rftn1Q6A0D4 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Rftn1Q6A0D4 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rftn1Q6A0D4 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rftn1Q6A0D4 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rftn1Q6A0D4 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rftn1Q6A0D4 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rftn1Q6A0D4 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rftn1Q6A0D4 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rftn1Q6A0D4 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rftn1Q6A0D4 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rftn1Q6A0D4 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rftn1Q6A0D4 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rftn1Q6A0D4 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rftn1Q6A0D4 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rftn1Q6A0D4 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rftn1Q6A0D4 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rftn1Q6A0D4 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rftn1Q6A0D4 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rftn1Q6A0D4 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Rftn1Q6A0D4 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rftn1Q6A0D4 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Rftn1Q6A0D4 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rftn1Q6A0D4 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rftn1Q6A0D4 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rftn1Q6A0D4 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms