Protein–RNA interactions for Protein: Q6A068

Cdc5l, Cell division cycle 5-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 802 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc5lQ6A068 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Cdc5lQ6A068 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Cdc5lQ6A068 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Cdc5lQ6A068 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Cdc5lQ6A068 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Cdc5lQ6A068 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Cdc5lQ6A068 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Cdc5lQ6A068 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Cdc5lQ6A068 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Cdc5lQ6A068 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Cdc5lQ6A068 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Cdc5lQ6A068 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Cdc5lQ6A068 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Cdc5lQ6A068 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Cdc5lQ6A068 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Cdc5lQ6A068 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Cdc5lQ6A068 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Cdc5lQ6A068 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Cdc5lQ6A068 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Cdc5lQ6A068 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Cdc5lQ6A068 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Cdc5lQ6A068 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Cdc5lQ6A068 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Cdc5lQ6A068 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Cdc5lQ6A068 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Cdc5lQ6A068 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Cdc5lQ6A068 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Cdc5lQ6A068 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Cdc5lQ6A068 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Cdc5lQ6A068 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Cdc5lQ6A068 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Cdc5lQ6A068 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Cdc5lQ6A068 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Cdc5lQ6A068 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Cdc5lQ6A068 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Cdc5lQ6A068 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Cdc5lQ6A068 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Cdc5lQ6A068 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Cdc5lQ6A068 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Cdc5lQ6A068 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Cdc5lQ6A068 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Cdc5lQ6A068 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Cdc5lQ6A068 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Cdc5lQ6A068 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Cdc5lQ6A068 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Cdc5lQ6A068 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Cdc5lQ6A068 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Cdc5lQ6A068 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Cdc5lQ6A068 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Cdc5lQ6A068 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Cdc5lQ6A068 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Cdc5lQ6A068 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Cdc5lQ6A068 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Cdc5lQ6A068 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Cdc5lQ6A068 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Cdc5lQ6A068 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Cdc5lQ6A068 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Cdc5lQ6A068 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
Cdc5lQ6A068 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Cdc5lQ6A068 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Cdc5lQ6A068 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Cdc5lQ6A068 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Cdc5lQ6A068 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Cdc5lQ6A068 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Cdc5lQ6A068 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Cdc5lQ6A068 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Cdc5lQ6A068 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Cdc5lQ6A068 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Cdc5lQ6A068 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Cdc5lQ6A068 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Cdc5lQ6A068 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Cdc5lQ6A068 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Cdc5lQ6A068 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Cdc5lQ6A068 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Cdc5lQ6A068 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Cdc5lQ6A068 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Cdc5lQ6A068 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
Cdc5lQ6A068 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Cdc5lQ6A068 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Cdc5lQ6A068 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Cdc5lQ6A068 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Cdc5lQ6A068 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Cdc5lQ6A068 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Cdc5lQ6A068 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Cdc5lQ6A068 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Cdc5lQ6A068 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Cdc5lQ6A068 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Cdc5lQ6A068 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Cdc5lQ6A068 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Cdc5lQ6A068 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Cdc5lQ6A068 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Cdc5lQ6A068 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Cdc5lQ6A068 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Cdc5lQ6A068 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Cdc5lQ6A068 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Cdc5lQ6A068 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Cdc5lQ6A068 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Cdc5lQ6A068 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Cdc5lQ6A068 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Cdc5lQ6A068 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms