Protein–RNA interactions for Protein: Q6A028

Swap70, Switch-associated protein 70, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Swap70Q6A028 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Swap70Q6A028 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Swap70Q6A028 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Swap70Q6A028 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Swap70Q6A028 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Swap70Q6A028 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Swap70Q6A028 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Swap70Q6A028 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Swap70Q6A028 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Swap70Q6A028 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Swap70Q6A028 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Swap70Q6A028 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Swap70Q6A028 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Swap70Q6A028 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Swap70Q6A028 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Swap70Q6A028 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Swap70Q6A028 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Swap70Q6A028 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Swap70Q6A028 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Swap70Q6A028 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Swap70Q6A028 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Swap70Q6A028 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Swap70Q6A028 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Swap70Q6A028 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Swap70Q6A028 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Swap70Q6A028 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Swap70Q6A028 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Swap70Q6A028 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Swap70Q6A028 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Swap70Q6A028 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Swap70Q6A028 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Swap70Q6A028 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Swap70Q6A028 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Swap70Q6A028 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Swap70Q6A028 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Swap70Q6A028 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Swap70Q6A028 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Swap70Q6A028 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Swap70Q6A028 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Swap70Q6A028 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Swap70Q6A028 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Swap70Q6A028 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Swap70Q6A028 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Swap70Q6A028 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Swap70Q6A028 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Swap70Q6A028 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Swap70Q6A028 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Swap70Q6A028 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Swap70Q6A028 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Swap70Q6A028 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Swap70Q6A028 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Swap70Q6A028 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Swap70Q6A028 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Swap70Q6A028 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Swap70Q6A028 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Swap70Q6A028 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Swap70Q6A028 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Swap70Q6A028 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Swap70Q6A028 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Swap70Q6A028 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Swap70Q6A028 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Swap70Q6A028 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Swap70Q6A028 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Swap70Q6A028 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Swap70Q6A028 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Swap70Q6A028 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Swap70Q6A028 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Swap70Q6A028 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Swap70Q6A028 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Swap70Q6A028 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Swap70Q6A028 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Swap70Q6A028 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Swap70Q6A028 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Swap70Q6A028 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Swap70Q6A028 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Swap70Q6A028 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Swap70Q6A028 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Swap70Q6A028 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Swap70Q6A028 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Swap70Q6A028 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Swap70Q6A028 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Swap70Q6A028 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Swap70Q6A028 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Swap70Q6A028 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Swap70Q6A028 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
Swap70Q6A028 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Swap70Q6A028 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Swap70Q6A028 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Swap70Q6A028 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Swap70Q6A028 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Swap70Q6A028 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Swap70Q6A028 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Swap70Q6A028 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Swap70Q6A028 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Swap70Q6A028 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Swap70Q6A028 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Swap70Q6A028 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Swap70Q6A028 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Swap70Q6A028 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Swap70Q6A028 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms