Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZF8

Msl2, E3 ubiquitin-protein ligase MSL2, mousemouse

Predictions only

Length 577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msl2Q69ZF8 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Msl2Q69ZF8 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Msl2Q69ZF8 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Msl2Q69ZF8 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Msl2Q69ZF8 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Msl2Q69ZF8 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Msl2Q69ZF8 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Msl2Q69ZF8 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Msl2Q69ZF8 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Msl2Q69ZF8 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Msl2Q69ZF8 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Msl2Q69ZF8 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Msl2Q69ZF8 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Msl2Q69ZF8 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Msl2Q69ZF8 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.7
Msl2Q69ZF8 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Msl2Q69ZF8 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Msl2Q69ZF8 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Msl2Q69ZF8 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Msl2Q69ZF8 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Msl2Q69ZF8 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Msl2Q69ZF8 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Msl2Q69ZF8 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Msl2Q69ZF8 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Msl2Q69ZF8 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Msl2Q69ZF8 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Msl2Q69ZF8 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Msl2Q69ZF8 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Msl2Q69ZF8 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Msl2Q69ZF8 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Msl2Q69ZF8 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Msl2Q69ZF8 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Msl2Q69ZF8 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Msl2Q69ZF8 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Msl2Q69ZF8 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Msl2Q69ZF8 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Msl2Q69ZF8 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Msl2Q69ZF8 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Msl2Q69ZF8 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Msl2Q69ZF8 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Msl2Q69ZF8 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Msl2Q69ZF8 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Msl2Q69ZF8 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Msl2Q69ZF8 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Msl2Q69ZF8 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Msl2Q69ZF8 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Msl2Q69ZF8 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Msl2Q69ZF8 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Msl2Q69ZF8 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Msl2Q69ZF8 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Msl2Q69ZF8 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Msl2Q69ZF8 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Msl2Q69ZF8 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Msl2Q69ZF8 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Msl2Q69ZF8 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Msl2Q69ZF8 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Msl2Q69ZF8 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Msl2Q69ZF8 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Msl2Q69ZF8 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Msl2Q69ZF8 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Msl2Q69ZF8 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Msl2Q69ZF8 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Msl2Q69ZF8 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Msl2Q69ZF8 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Msl2Q69ZF8 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Msl2Q69ZF8 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Msl2Q69ZF8 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Msl2Q69ZF8 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Msl2Q69ZF8 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Msl2Q69ZF8 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Msl2Q69ZF8 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Msl2Q69ZF8 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Msl2Q69ZF8 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Msl2Q69ZF8 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Msl2Q69ZF8 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Msl2Q69ZF8 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Msl2Q69ZF8 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Msl2Q69ZF8 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Msl2Q69ZF8 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Msl2Q69ZF8 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Msl2Q69ZF8 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Msl2Q69ZF8 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Msl2Q69ZF8 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Msl2Q69ZF8 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Msl2Q69ZF8 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Msl2Q69ZF8 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Msl2Q69ZF8 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Msl2Q69ZF8 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Msl2Q69ZF8 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Msl2Q69ZF8 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Msl2Q69ZF8 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Msl2Q69ZF8 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Msl2Q69ZF8 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Msl2Q69ZF8 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Msl2Q69ZF8 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Msl2Q69ZF8 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Msl2Q69ZF8 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Msl2Q69ZF8 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Msl2Q69ZF8 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Msl2Q69ZF8 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms