Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZB0

Lrrcc1, Leucine-rich repeat and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,026 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrcc1Q69ZB0 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Lrrcc1Q69ZB0 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Lrrcc1Q69ZB0 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Lrrcc1Q69ZB0 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Lrrcc1Q69ZB0 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Lrrcc1Q69ZB0 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Lrrcc1Q69ZB0 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Lrrcc1Q69ZB0 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Lrrcc1Q69ZB0 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Lrrcc1Q69ZB0 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Lrrcc1Q69ZB0 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Lrrcc1Q69ZB0 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Lrrcc1Q69ZB0 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Lrrcc1Q69ZB0 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Lrrcc1Q69ZB0 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Lrrcc1Q69ZB0 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Lrrcc1Q69ZB0 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Lrrcc1Q69ZB0 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Lrrcc1Q69ZB0 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Lrrcc1Q69ZB0 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Lrrcc1Q69ZB0 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Lrrcc1Q69ZB0 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Lrrcc1Q69ZB0 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Lrrcc1Q69ZB0 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Lrrcc1Q69ZB0 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Lrrcc1Q69ZB0 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Lrrcc1Q69ZB0 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Lrrcc1Q69ZB0 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Lrrcc1Q69ZB0 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Lrrcc1Q69ZB0 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Lrrcc1Q69ZB0 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Lrrcc1Q69ZB0 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Lrrcc1Q69ZB0 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Lrrcc1Q69ZB0 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Lrrcc1Q69ZB0 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Lrrcc1Q69ZB0 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Lrrcc1Q69ZB0 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Lrrcc1Q69ZB0 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Lrrcc1Q69ZB0 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Lrrcc1Q69ZB0 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Lrrcc1Q69ZB0 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Lrrcc1Q69ZB0 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Lrrcc1Q69ZB0 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Lrrcc1Q69ZB0 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Lrrcc1Q69ZB0 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Lrrcc1Q69ZB0 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Lrrcc1Q69ZB0 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Lrrcc1Q69ZB0 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Lrrcc1Q69ZB0 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Lrrcc1Q69ZB0 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Lrrcc1Q69ZB0 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Lrrcc1Q69ZB0 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Lrrcc1Q69ZB0 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Lrrcc1Q69ZB0 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Lrrcc1Q69ZB0 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Lrrcc1Q69ZB0 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Lrrcc1Q69ZB0 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Lrrcc1Q69ZB0 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Lrrcc1Q69ZB0 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Lrrcc1Q69ZB0 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Lrrcc1Q69ZB0 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Lrrcc1Q69ZB0 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Lrrcc1Q69ZB0 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Lrrcc1Q69ZB0 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Lrrcc1Q69ZB0 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Lrrcc1Q69ZB0 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Lrrcc1Q69ZB0 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Lrrcc1Q69ZB0 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Lrrcc1Q69ZB0 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Lrrcc1Q69ZB0 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Lrrcc1Q69ZB0 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Lrrcc1Q69ZB0 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Lrrcc1Q69ZB0 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Lrrcc1Q69ZB0 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Lrrcc1Q69ZB0 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Lrrcc1Q69ZB0 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Lrrcc1Q69ZB0 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Lrrcc1Q69ZB0 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Lrrcc1Q69ZB0 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Lrrcc1Q69ZB0 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Lrrcc1Q69ZB0 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Lrrcc1Q69ZB0 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Lrrcc1Q69ZB0 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Lrrcc1Q69ZB0 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Lrrcc1Q69ZB0 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Lrrcc1Q69ZB0 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Lrrcc1Q69ZB0 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Lrrcc1Q69ZB0 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Lrrcc1Q69ZB0 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Lrrcc1Q69ZB0 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Lrrcc1Q69ZB0 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Lrrcc1Q69ZB0 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Lrrcc1Q69ZB0 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Lrrcc1Q69ZB0 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Lrrcc1Q69ZB0 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Lrrcc1Q69ZB0 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Lrrcc1Q69ZB0 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Lrrcc1Q69ZB0 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Lrrcc1Q69ZB0 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Lrrcc1Q69ZB0 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms