Protein–RNA interactions for Protein: Q69Z98

Brsk2, Serine/threonine-protein kinase BRSK2, mousemouse

Predictions only

Length 735 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brsk2Q69Z98 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Brsk2Q69Z98 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Brsk2Q69Z98 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Brsk2Q69Z98 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Brsk2Q69Z98 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Brsk2Q69Z98 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Brsk2Q69Z98 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Brsk2Q69Z98 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Brsk2Q69Z98 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Brsk2Q69Z98 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Brsk2Q69Z98 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Brsk2Q69Z98 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Brsk2Q69Z98 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Brsk2Q69Z98 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Brsk2Q69Z98 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Brsk2Q69Z98 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Brsk2Q69Z98 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Brsk2Q69Z98 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Brsk2Q69Z98 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Brsk2Q69Z98 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Brsk2Q69Z98 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Brsk2Q69Z98 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Brsk2Q69Z98 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Brsk2Q69Z98 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Brsk2Q69Z98 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Brsk2Q69Z98 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Brsk2Q69Z98 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Brsk2Q69Z98 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Brsk2Q69Z98 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Brsk2Q69Z98 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Brsk2Q69Z98 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Brsk2Q69Z98 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Brsk2Q69Z98 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Brsk2Q69Z98 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Brsk2Q69Z98 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Brsk2Q69Z98 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Brsk2Q69Z98 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Brsk2Q69Z98 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Brsk2Q69Z98 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Brsk2Q69Z98 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Brsk2Q69Z98 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Brsk2Q69Z98 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Brsk2Q69Z98 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Brsk2Q69Z98 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Brsk2Q69Z98 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Brsk2Q69Z98 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Brsk2Q69Z98 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Brsk2Q69Z98 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Brsk2Q69Z98 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Brsk2Q69Z98 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Brsk2Q69Z98 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Brsk2Q69Z98 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Brsk2Q69Z98 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Brsk2Q69Z98 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Brsk2Q69Z98 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Brsk2Q69Z98 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Brsk2Q69Z98 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Brsk2Q69Z98 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Brsk2Q69Z98 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Brsk2Q69Z98 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Brsk2Q69Z98 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Brsk2Q69Z98 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Brsk2Q69Z98 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Brsk2Q69Z98 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Brsk2Q69Z98 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Brsk2Q69Z98 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Brsk2Q69Z98 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Brsk2Q69Z98 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Brsk2Q69Z98 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Brsk2Q69Z98 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Brsk2Q69Z98 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Brsk2Q69Z98 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Brsk2Q69Z98 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Brsk2Q69Z98 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Brsk2Q69Z98 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Brsk2Q69Z98 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Brsk2Q69Z98 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Brsk2Q69Z98 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Brsk2Q69Z98 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Brsk2Q69Z98 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Brsk2Q69Z98 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Brsk2Q69Z98 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Brsk2Q69Z98 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Brsk2Q69Z98 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Brsk2Q69Z98 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Brsk2Q69Z98 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Brsk2Q69Z98 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Brsk2Q69Z98 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Brsk2Q69Z98 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Brsk2Q69Z98 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Brsk2Q69Z98 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Brsk2Q69Z98 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Brsk2Q69Z98 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Brsk2Q69Z98 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Brsk2Q69Z98 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Brsk2Q69Z98 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Brsk2Q69Z98 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Brsk2Q69Z98 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Brsk2Q69Z98 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Brsk2Q69Z98 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms