Protein–RNA interactions for Protein: Q68FH4

Galk2, N-acetylgalactosamine kinase, mousemouse

Predictions only

Length 458 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Galk2Q68FH4 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Galk2Q68FH4 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Galk2Q68FH4 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Galk2Q68FH4 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Galk2Q68FH4 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Galk2Q68FH4 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Galk2Q68FH4 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Galk2Q68FH4 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Galk2Q68FH4 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Galk2Q68FH4 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Galk2Q68FH4 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Galk2Q68FH4 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Galk2Q68FH4 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Galk2Q68FH4 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Galk2Q68FH4 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Galk2Q68FH4 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Galk2Q68FH4 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Galk2Q68FH4 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Galk2Q68FH4 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Galk2Q68FH4 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Galk2Q68FH4 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Galk2Q68FH4 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Galk2Q68FH4 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Galk2Q68FH4 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Galk2Q68FH4 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Galk2Q68FH4 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Galk2Q68FH4 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Galk2Q68FH4 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Galk2Q68FH4 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Galk2Q68FH4 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Galk2Q68FH4 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Galk2Q68FH4 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Galk2Q68FH4 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Galk2Q68FH4 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Galk2Q68FH4 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Galk2Q68FH4 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Galk2Q68FH4 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Galk2Q68FH4 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Galk2Q68FH4 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Galk2Q68FH4 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Galk2Q68FH4 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Galk2Q68FH4 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Galk2Q68FH4 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Galk2Q68FH4 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Galk2Q68FH4 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Galk2Q68FH4 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Galk2Q68FH4 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Galk2Q68FH4 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Galk2Q68FH4 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Galk2Q68FH4 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Galk2Q68FH4 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Galk2Q68FH4 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Galk2Q68FH4 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Galk2Q68FH4 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Galk2Q68FH4 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Galk2Q68FH4 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Galk2Q68FH4 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Galk2Q68FH4 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Galk2Q68FH4 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Galk2Q68FH4 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Galk2Q68FH4 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Galk2Q68FH4 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Galk2Q68FH4 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Galk2Q68FH4 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Galk2Q68FH4 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Galk2Q68FH4 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Galk2Q68FH4 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Galk2Q68FH4 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Galk2Q68FH4 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Galk2Q68FH4 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Galk2Q68FH4 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Galk2Q68FH4 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Galk2Q68FH4 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Galk2Q68FH4 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Galk2Q68FH4 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Galk2Q68FH4 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Galk2Q68FH4 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Galk2Q68FH4 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Galk2Q68FH4 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Galk2Q68FH4 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Galk2Q68FH4 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Galk2Q68FH4 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Galk2Q68FH4 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Galk2Q68FH4 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Galk2Q68FH4 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Galk2Q68FH4 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Galk2Q68FH4 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Galk2Q68FH4 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Galk2Q68FH4 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Galk2Q68FH4 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Galk2Q68FH4 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Galk2Q68FH4 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Galk2Q68FH4 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Galk2Q68FH4 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Galk2Q68FH4 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Galk2Q68FH4 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Galk2Q68FH4 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Galk2Q68FH4 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Galk2Q68FH4 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Galk2Q68FH4 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 107.2 ms