Protein–RNA interactions for Protein: Q68FE8

Znf280d, Zinc finger protein 280D, mousemouse

Predictions only

Length 974 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf280dQ68FE8 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Znf280dQ68FE8 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Znf280dQ68FE8 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Znf280dQ68FE8 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Znf280dQ68FE8 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Znf280dQ68FE8 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Znf280dQ68FE8 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Znf280dQ68FE8 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Znf280dQ68FE8 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Znf280dQ68FE8 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Znf280dQ68FE8 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Znf280dQ68FE8 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Znf280dQ68FE8 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Znf280dQ68FE8 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Znf280dQ68FE8 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Znf280dQ68FE8 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Znf280dQ68FE8 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Znf280dQ68FE8 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Znf280dQ68FE8 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Znf280dQ68FE8 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Znf280dQ68FE8 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Znf280dQ68FE8 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Znf280dQ68FE8 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Znf280dQ68FE8 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Znf280dQ68FE8 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Znf280dQ68FE8 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Znf280dQ68FE8 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Znf280dQ68FE8 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Znf280dQ68FE8 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Znf280dQ68FE8 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Znf280dQ68FE8 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Znf280dQ68FE8 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Znf280dQ68FE8 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Znf280dQ68FE8 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Znf280dQ68FE8 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Znf280dQ68FE8 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Znf280dQ68FE8 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Znf280dQ68FE8 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Znf280dQ68FE8 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Znf280dQ68FE8 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Znf280dQ68FE8 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Znf280dQ68FE8 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Znf280dQ68FE8 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Znf280dQ68FE8 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Znf280dQ68FE8 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Znf280dQ68FE8 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Znf280dQ68FE8 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Znf280dQ68FE8 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Znf280dQ68FE8 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Znf280dQ68FE8 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Znf280dQ68FE8 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Znf280dQ68FE8 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Znf280dQ68FE8 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Znf280dQ68FE8 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Znf280dQ68FE8 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Znf280dQ68FE8 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Znf280dQ68FE8 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Znf280dQ68FE8 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Znf280dQ68FE8 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Znf280dQ68FE8 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Znf280dQ68FE8 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Znf280dQ68FE8 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Znf280dQ68FE8 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Znf280dQ68FE8 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Znf280dQ68FE8 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Znf280dQ68FE8 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Znf280dQ68FE8 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Znf280dQ68FE8 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Znf280dQ68FE8 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Znf280dQ68FE8 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Znf280dQ68FE8 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Znf280dQ68FE8 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Znf280dQ68FE8 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Znf280dQ68FE8 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Znf280dQ68FE8 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Znf280dQ68FE8 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Znf280dQ68FE8 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Znf280dQ68FE8 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Znf280dQ68FE8 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Znf280dQ68FE8 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Znf280dQ68FE8 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Znf280dQ68FE8 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Znf280dQ68FE8 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Znf280dQ68FE8 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Znf280dQ68FE8 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Znf280dQ68FE8 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Znf280dQ68FE8 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Znf280dQ68FE8 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Znf280dQ68FE8 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Znf280dQ68FE8 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Znf280dQ68FE8 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Znf280dQ68FE8 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Znf280dQ68FE8 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Znf280dQ68FE8 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Znf280dQ68FE8 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Znf280dQ68FE8 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Znf280dQ68FE8 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Znf280dQ68FE8 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Znf280dQ68FE8 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Znf280dQ68FE8 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms