Protein–RNA interactions for Protein: Q68FD7

Fnip1, Folliculin-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,165 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fnip1Q68FD7 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Fnip1Q68FD7 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Fnip1Q68FD7 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Fnip1Q68FD7 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Fnip1Q68FD7 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Fnip1Q68FD7 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Fnip1Q68FD7 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Fnip1Q68FD7 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Fnip1Q68FD7 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Fnip1Q68FD7 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Fnip1Q68FD7 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Fnip1Q68FD7 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Fnip1Q68FD7 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Fnip1Q68FD7 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Fnip1Q68FD7 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Fnip1Q68FD7 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Fnip1Q68FD7 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Fnip1Q68FD7 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Fnip1Q68FD7 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Fnip1Q68FD7 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Fnip1Q68FD7 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Fnip1Q68FD7 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Fnip1Q68FD7 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Fnip1Q68FD7 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Fnip1Q68FD7 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Fnip1Q68FD7 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Fnip1Q68FD7 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Fnip1Q68FD7 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Fnip1Q68FD7 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Fnip1Q68FD7 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Fnip1Q68FD7 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Fnip1Q68FD7 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Fnip1Q68FD7 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Fnip1Q68FD7 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Fnip1Q68FD7 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Fnip1Q68FD7 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Fnip1Q68FD7 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Fnip1Q68FD7 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Fnip1Q68FD7 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Fnip1Q68FD7 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Fnip1Q68FD7 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Fnip1Q68FD7 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Fnip1Q68FD7 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Fnip1Q68FD7 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Fnip1Q68FD7 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Fnip1Q68FD7 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Fnip1Q68FD7 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Fnip1Q68FD7 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Fnip1Q68FD7 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Fnip1Q68FD7 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Fnip1Q68FD7 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Fnip1Q68FD7 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Fnip1Q68FD7 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Fnip1Q68FD7 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Fnip1Q68FD7 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Fnip1Q68FD7 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Fnip1Q68FD7 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Fnip1Q68FD7 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Fnip1Q68FD7 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Fnip1Q68FD7 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Fnip1Q68FD7 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Fnip1Q68FD7 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Fnip1Q68FD7 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Fnip1Q68FD7 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Fnip1Q68FD7 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Fnip1Q68FD7 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Fnip1Q68FD7 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Fnip1Q68FD7 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Fnip1Q68FD7 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Fnip1Q68FD7 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Fnip1Q68FD7 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Fnip1Q68FD7 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Fnip1Q68FD7 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Fnip1Q68FD7 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Fnip1Q68FD7 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Fnip1Q68FD7 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Fnip1Q68FD7 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Fnip1Q68FD7 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Fnip1Q68FD7 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Fnip1Q68FD7 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Fnip1Q68FD7 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Fnip1Q68FD7 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Fnip1Q68FD7 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Fnip1Q68FD7 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Fnip1Q68FD7 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Fnip1Q68FD7 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Fnip1Q68FD7 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Fnip1Q68FD7 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Fnip1Q68FD7 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Fnip1Q68FD7 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Fnip1Q68FD7 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Fnip1Q68FD7 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Fnip1Q68FD7 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Fnip1Q68FD7 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Fnip1Q68FD7 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Fnip1Q68FD7 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Fnip1Q68FD7 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Fnip1Q68FD7 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Fnip1Q68FD7 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Fnip1Q68FD7 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms