Protein–RNA interactions for Protein: Q68FD5

Cltc, Clathrin heavy chain 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,675 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltcQ68FD5 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC33.09■■■□□ 2.89
CltcQ68FD5 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC33.08■■■□□ 2.89
CltcQ68FD5 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
CltcQ68FD5 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
CltcQ68FD5 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
CltcQ68FD5 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
CltcQ68FD5 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.88
CltcQ68FD5 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC33.07■■■□□ 2.88
CltcQ68FD5 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC33.06■■■□□ 2.88
CltcQ68FD5 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC33.06■■■□□ 2.88
CltcQ68FD5 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
CltcQ68FD5 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
CltcQ68FD5 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
CltcQ68FD5 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
CltcQ68FD5 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
CltcQ68FD5 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC33.04■■■□□ 2.88
CltcQ68FD5 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
CltcQ68FD5 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC33.03■■■□□ 2.88
CltcQ68FD5 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC33.02■■■□□ 2.88
CltcQ68FD5 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
CltcQ68FD5 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.01■■■□□ 2.88
CltcQ68FD5 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
CltcQ68FD5 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
CltcQ68FD5 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC33■■■□□ 2.87
CltcQ68FD5 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC32.97■■■□□ 2.87
CltcQ68FD5 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC32.97■■■□□ 2.87
CltcQ68FD5 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC32.97■■■□□ 2.87
CltcQ68FD5 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
CltcQ68FD5 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
CltcQ68FD5 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC32.96■■■□□ 2.87
CltcQ68FD5 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
CltcQ68FD5 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
CltcQ68FD5 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
CltcQ68FD5 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.93■■■□□ 2.86
CltcQ68FD5 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
CltcQ68FD5 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
CltcQ68FD5 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
CltcQ68FD5 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
CltcQ68FD5 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC32.91■■■□□ 2.86
CltcQ68FD5 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
CltcQ68FD5 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
CltcQ68FD5 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC32.91■■■□□ 2.86
CltcQ68FD5 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
CltcQ68FD5 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
CltcQ68FD5 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC32.9■■■□□ 2.86
CltcQ68FD5 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
CltcQ68FD5 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC32.9■■■□□ 2.86
CltcQ68FD5 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC32.9■■■□□ 2.86
CltcQ68FD5 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
CltcQ68FD5 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
CltcQ68FD5 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
CltcQ68FD5 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
CltcQ68FD5 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.89■■■□□ 2.86
CltcQ68FD5 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.88■■■□□ 2.85
CltcQ68FD5 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC32.88■■■□□ 2.85
CltcQ68FD5 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
CltcQ68FD5 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC32.88■■■□□ 2.85
CltcQ68FD5 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
CltcQ68FD5 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.88■■■□□ 2.85
CltcQ68FD5 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC32.88■■■□□ 2.85
CltcQ68FD5 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
CltcQ68FD5 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
CltcQ68FD5 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
CltcQ68FD5 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
CltcQ68FD5 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
CltcQ68FD5 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
CltcQ68FD5 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
CltcQ68FD5 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
CltcQ68FD5 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.85■■■□□ 2.85
CltcQ68FD5 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.85■■■□□ 2.85
CltcQ68FD5 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
CltcQ68FD5 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
CltcQ68FD5 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
CltcQ68FD5 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC32.83■■■□□ 2.85
CltcQ68FD5 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
CltcQ68FD5 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
CltcQ68FD5 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC32.82■■■□□ 2.84
CltcQ68FD5 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
CltcQ68FD5 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
CltcQ68FD5 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
CltcQ68FD5 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
CltcQ68FD5 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC32.81■■■□□ 2.84
CltcQ68FD5 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC32.81■■■□□ 2.84
CltcQ68FD5 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC32.81■■■□□ 2.84
CltcQ68FD5 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
CltcQ68FD5 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
CltcQ68FD5 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
CltcQ68FD5 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC32.79■■■□□ 2.84
CltcQ68FD5 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
CltcQ68FD5 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
CltcQ68FD5 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
CltcQ68FD5 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
CltcQ68FD5 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
CltcQ68FD5 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC32.78■■■□□ 2.84
CltcQ68FD5 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
CltcQ68FD5 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
CltcQ68FD5 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
CltcQ68FD5 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
CltcQ68FD5 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
CltcQ68FD5 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC32.75■■■□□ 2.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms