Protein–RNA interactions for Protein: Q64104

Nr2e1, Nuclear receptor subfamily 2 group E member 1, mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr2e1Q64104 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nr2e1Q64104 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nr2e1Q64104 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nr2e1Q64104 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nr2e1Q64104 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nr2e1Q64104 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nr2e1Q64104 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nr2e1Q64104 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nr2e1Q64104 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Nr2e1Q64104 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nr2e1Q64104 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nr2e1Q64104 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nr2e1Q64104 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nr2e1Q64104 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nr2e1Q64104 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nr2e1Q64104 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nr2e1Q64104 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nr2e1Q64104 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Nr2e1Q64104 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nr2e1Q64104 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nr2e1Q64104 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nr2e1Q64104 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nr2e1Q64104 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nr2e1Q64104 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nr2e1Q64104 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nr2e1Q64104 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nr2e1Q64104 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nr2e1Q64104 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nr2e1Q64104 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nr2e1Q64104 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nr2e1Q64104 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nr2e1Q64104 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Nr2e1Q64104 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nr2e1Q64104 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nr2e1Q64104 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nr2e1Q64104 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nr2e1Q64104 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Nr2e1Q64104 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nr2e1Q64104 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Nr2e1Q64104 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nr2e1Q64104 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nr2e1Q64104 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nr2e1Q64104 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Nr2e1Q64104 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nr2e1Q64104 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nr2e1Q64104 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nr2e1Q64104 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nr2e1Q64104 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nr2e1Q64104 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nr2e1Q64104 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nr2e1Q64104 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Nr2e1Q64104 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nr2e1Q64104 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nr2e1Q64104 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nr2e1Q64104 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nr2e1Q64104 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nr2e1Q64104 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Nr2e1Q64104 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Nr2e1Q64104 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Nr2e1Q64104 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Nr2e1Q64104 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nr2e1Q64104 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nr2e1Q64104 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nr2e1Q64104 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Nr2e1Q64104 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nr2e1Q64104 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nr2e1Q64104 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nr2e1Q64104 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Nr2e1Q64104 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nr2e1Q64104 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nr2e1Q64104 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Nr2e1Q64104 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Nr2e1Q64104 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Nr2e1Q64104 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Nr2e1Q64104 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Nr2e1Q64104 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Nr2e1Q64104 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Nr2e1Q64104 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nr2e1Q64104 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nr2e1Q64104 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nr2e1Q64104 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nr2e1Q64104 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nr2e1Q64104 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nr2e1Q64104 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nr2e1Q64104 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nr2e1Q64104 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nr2e1Q64104 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nr2e1Q64104 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nr2e1Q64104 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nr2e1Q64104 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Nr2e1Q64104 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nr2e1Q64104 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nr2e1Q64104 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nr2e1Q64104 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nr2e1Q64104 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nr2e1Q64104 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nr2e1Q64104 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nr2e1Q64104 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nr2e1Q64104 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nr2e1Q64104 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.5 ms