Protein–RNA interactions for Protein: Q62481

Vps72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps72Q62481 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Vps72Q62481 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Vps72Q62481 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Vps72Q62481 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Vps72Q62481 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Vps72Q62481 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Vps72Q62481 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Vps72Q62481 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Vps72Q62481 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Vps72Q62481 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Vps72Q62481 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Vps72Q62481 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Vps72Q62481 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Vps72Q62481 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Vps72Q62481 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Vps72Q62481 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Vps72Q62481 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Vps72Q62481 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Vps72Q62481 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Vps72Q62481 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Vps72Q62481 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Vps72Q62481 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Vps72Q62481 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Vps72Q62481 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Vps72Q62481 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Vps72Q62481 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Vps72Q62481 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Vps72Q62481 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Vps72Q62481 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Vps72Q62481 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Vps72Q62481 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Vps72Q62481 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Vps72Q62481 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Vps72Q62481 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Vps72Q62481 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Vps72Q62481 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Vps72Q62481 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Vps72Q62481 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Vps72Q62481 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Vps72Q62481 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Vps72Q62481 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Vps72Q62481 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Vps72Q62481 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Vps72Q62481 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Vps72Q62481 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Vps72Q62481 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Vps72Q62481 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Vps72Q62481 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Vps72Q62481 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Vps72Q62481 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Vps72Q62481 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Vps72Q62481 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Vps72Q62481 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Vps72Q62481 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Vps72Q62481 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Vps72Q62481 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Vps72Q62481 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Vps72Q62481 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Vps72Q62481 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Vps72Q62481 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Vps72Q62481 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Vps72Q62481 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Vps72Q62481 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Vps72Q62481 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Vps72Q62481 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Vps72Q62481 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Vps72Q62481 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Vps72Q62481 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Vps72Q62481 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Vps72Q62481 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Vps72Q62481 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Vps72Q62481 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Vps72Q62481 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Vps72Q62481 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Vps72Q62481 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Vps72Q62481 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Vps72Q62481 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Vps72Q62481 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Vps72Q62481 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Vps72Q62481 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Vps72Q62481 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Vps72Q62481 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Vps72Q62481 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Vps72Q62481 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Vps72Q62481 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Vps72Q62481 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Vps72Q62481 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Vps72Q62481 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Vps72Q62481 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Vps72Q62481 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Vps72Q62481 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Vps72Q62481 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Vps72Q62481 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Vps72Q62481 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Vps72Q62481 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Vps72Q62481 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Vps72Q62481 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Vps72Q62481 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Vps72Q62481 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Vps72Q62481 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms