Protein–RNA interactions for Protein: Q62424

Hoxa13, Homeobox protein Hox-A13, mousemouse

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Length 386 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa13Q62424 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Hoxa13Q62424 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Hoxa13Q62424 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Hoxa13Q62424 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Hoxa13Q62424 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Hoxa13Q62424 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Hoxa13Q62424 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Hoxa13Q62424 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Hoxa13Q62424 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Hoxa13Q62424 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Hoxa13Q62424 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Hoxa13Q62424 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Hoxa13Q62424 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Hoxa13Q62424 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Hoxa13Q62424 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Hoxa13Q62424 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Hoxa13Q62424 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Hoxa13Q62424 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Hoxa13Q62424 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Hoxa13Q62424 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Hoxa13Q62424 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Hoxa13Q62424 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Hoxa13Q62424 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Hoxa13Q62424 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Hoxa13Q62424 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Hoxa13Q62424 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Hoxa13Q62424 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Hoxa13Q62424 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Hoxa13Q62424 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Hoxa13Q62424 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Hoxa13Q62424 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Hoxa13Q62424 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Hoxa13Q62424 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Hoxa13Q62424 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Hoxa13Q62424 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Hoxa13Q62424 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Hoxa13Q62424 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Hoxa13Q62424 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Hoxa13Q62424 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Hoxa13Q62424 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Hoxa13Q62424 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Hoxa13Q62424 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Hoxa13Q62424 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Hoxa13Q62424 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Hoxa13Q62424 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Hoxa13Q62424 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Hoxa13Q62424 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Hoxa13Q62424 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Hoxa13Q62424 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Hoxa13Q62424 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Hoxa13Q62424 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Hoxa13Q62424 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Hoxa13Q62424 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Hoxa13Q62424 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Hoxa13Q62424 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Hoxa13Q62424 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Hoxa13Q62424 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Hoxa13Q62424 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Hoxa13Q62424 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Hoxa13Q62424 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Hoxa13Q62424 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
Hoxa13Q62424 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Hoxa13Q62424 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Hoxa13Q62424 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Hoxa13Q62424 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Hoxa13Q62424 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Hoxa13Q62424 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Hoxa13Q62424 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Hoxa13Q62424 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Hoxa13Q62424 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Hoxa13Q62424 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Hoxa13Q62424 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Hoxa13Q62424 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Hoxa13Q62424 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Hoxa13Q62424 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Hoxa13Q62424 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Hoxa13Q62424 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Hoxa13Q62424 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Hoxa13Q62424 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Hoxa13Q62424 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Hoxa13Q62424 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Hoxa13Q62424 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Hoxa13Q62424 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Hoxa13Q62424 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Hoxa13Q62424 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Hoxa13Q62424 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Hoxa13Q62424 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Hoxa13Q62424 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Hoxa13Q62424 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Hoxa13Q62424 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Hoxa13Q62424 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Hoxa13Q62424 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Hoxa13Q62424 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Hoxa13Q62424 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Hoxa13Q62424 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Hoxa13Q62424 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Hoxa13Q62424 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Hoxa13Q62424 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Hoxa13Q62424 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Hoxa13Q62424 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
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