Protein–RNA interactions for Protein: Q62132

Ptprr, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase R, mousemouse

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Length 656 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprrQ62132 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PtprrQ62132 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PtprrQ62132 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PtprrQ62132 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PtprrQ62132 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PtprrQ62132 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PtprrQ62132 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PtprrQ62132 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PtprrQ62132 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PtprrQ62132 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PtprrQ62132 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PtprrQ62132 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PtprrQ62132 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PtprrQ62132 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PtprrQ62132 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PtprrQ62132 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PtprrQ62132 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PtprrQ62132 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PtprrQ62132 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PtprrQ62132 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PtprrQ62132 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PtprrQ62132 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PtprrQ62132 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PtprrQ62132 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PtprrQ62132 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PtprrQ62132 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PtprrQ62132 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PtprrQ62132 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PtprrQ62132 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PtprrQ62132 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PtprrQ62132 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PtprrQ62132 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PtprrQ62132 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PtprrQ62132 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PtprrQ62132 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PtprrQ62132 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PtprrQ62132 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PtprrQ62132 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PtprrQ62132 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PtprrQ62132 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PtprrQ62132 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PtprrQ62132 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PtprrQ62132 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PtprrQ62132 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PtprrQ62132 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PtprrQ62132 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PtprrQ62132 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PtprrQ62132 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PtprrQ62132 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PtprrQ62132 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PtprrQ62132 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PtprrQ62132 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PtprrQ62132 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PtprrQ62132 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PtprrQ62132 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PtprrQ62132 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
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PtprrQ62132 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PtprrQ62132 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PtprrQ62132 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PtprrQ62132 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PtprrQ62132 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PtprrQ62132 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PtprrQ62132 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PtprrQ62132 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PtprrQ62132 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PtprrQ62132 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PtprrQ62132 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PtprrQ62132 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PtprrQ62132 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PtprrQ62132 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PtprrQ62132 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PtprrQ62132 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PtprrQ62132 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PtprrQ62132 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PtprrQ62132 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PtprrQ62132 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PtprrQ62132 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PtprrQ62132 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PtprrQ62132 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PtprrQ62132 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PtprrQ62132 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PtprrQ62132 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PtprrQ62132 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PtprrQ62132 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PtprrQ62132 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PtprrQ62132 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PtprrQ62132 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PtprrQ62132 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PtprrQ62132 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PtprrQ62132 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PtprrQ62132 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PtprrQ62132 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PtprrQ62132 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PtprrQ62132 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PtprrQ62132 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PtprrQ62132 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PtprrQ62132 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PtprrQ62132 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PtprrQ62132 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 109.1 ms