Protein–RNA interactions for Protein: Q61765

Krt31, Keratin, type I cuticular Ha1, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt31Q61765 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Krt31Q61765 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Krt31Q61765 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Krt31Q61765 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Krt31Q61765 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Krt31Q61765 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Krt31Q61765 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Krt31Q61765 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Krt31Q61765 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Krt31Q61765 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Krt31Q61765 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Krt31Q61765 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Krt31Q61765 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Krt31Q61765 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Krt31Q61765 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Krt31Q61765 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Krt31Q61765 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Krt31Q61765 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Krt31Q61765 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Krt31Q61765 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Krt31Q61765 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Krt31Q61765 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Krt31Q61765 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Krt31Q61765 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Krt31Q61765 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Krt31Q61765 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Krt31Q61765 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Krt31Q61765 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Krt31Q61765 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Krt31Q61765 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Krt31Q61765 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Krt31Q61765 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Krt31Q61765 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Krt31Q61765 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Krt31Q61765 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Krt31Q61765 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Krt31Q61765 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Krt31Q61765 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Krt31Q61765 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Krt31Q61765 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Krt31Q61765 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Krt31Q61765 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Krt31Q61765 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Krt31Q61765 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Krt31Q61765 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Krt31Q61765 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Krt31Q61765 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Krt31Q61765 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Krt31Q61765 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Krt31Q61765 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Krt31Q61765 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Krt31Q61765 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Krt31Q61765 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Krt31Q61765 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Krt31Q61765 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Krt31Q61765 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Krt31Q61765 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Krt31Q61765 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Krt31Q61765 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Krt31Q61765 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Krt31Q61765 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Krt31Q61765 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Krt31Q61765 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Krt31Q61765 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Krt31Q61765 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Krt31Q61765 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Krt31Q61765 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Krt31Q61765 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Krt31Q61765 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Krt31Q61765 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Krt31Q61765 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Krt31Q61765 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Krt31Q61765 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Krt31Q61765 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Krt31Q61765 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Krt31Q61765 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Krt31Q61765 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Krt31Q61765 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Krt31Q61765 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Krt31Q61765 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Krt31Q61765 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Krt31Q61765 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Krt31Q61765 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Krt31Q61765 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Krt31Q61765 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Krt31Q61765 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Krt31Q61765 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Krt31Q61765 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Krt31Q61765 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Krt31Q61765 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Krt31Q61765 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Krt31Q61765 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Krt31Q61765 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Krt31Q61765 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Krt31Q61765 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Krt31Q61765 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Krt31Q61765 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Krt31Q61765 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Krt31Q61765 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Krt31Q61765 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.3 ms