Protein–RNA interactions for Protein: Q61644

Pacsin1, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 1, mousemouse

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Length 441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin1Q61644 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Pacsin1Q61644 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pacsin1Q61644 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pacsin1Q61644 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pacsin1Q61644 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pacsin1Q61644 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pacsin1Q61644 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pacsin1Q61644 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pacsin1Q61644 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pacsin1Q61644 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pacsin1Q61644 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pacsin1Q61644 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pacsin1Q61644 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pacsin1Q61644 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pacsin1Q61644 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pacsin1Q61644 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pacsin1Q61644 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pacsin1Q61644 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pacsin1Q61644 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pacsin1Q61644 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pacsin1Q61644 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pacsin1Q61644 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pacsin1Q61644 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pacsin1Q61644 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pacsin1Q61644 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pacsin1Q61644 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pacsin1Q61644 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pacsin1Q61644 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Pacsin1Q61644 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pacsin1Q61644 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pacsin1Q61644 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pacsin1Q61644 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pacsin1Q61644 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Pacsin1Q61644 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pacsin1Q61644 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pacsin1Q61644 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pacsin1Q61644 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pacsin1Q61644 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pacsin1Q61644 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pacsin1Q61644 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pacsin1Q61644 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pacsin1Q61644 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Pacsin1Q61644 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pacsin1Q61644 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pacsin1Q61644 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pacsin1Q61644 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pacsin1Q61644 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pacsin1Q61644 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pacsin1Q61644 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Pacsin1Q61644 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pacsin1Q61644 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pacsin1Q61644 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pacsin1Q61644 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pacsin1Q61644 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pacsin1Q61644 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pacsin1Q61644 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pacsin1Q61644 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pacsin1Q61644 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pacsin1Q61644 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Pacsin1Q61644 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pacsin1Q61644 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pacsin1Q61644 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pacsin1Q61644 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pacsin1Q61644 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pacsin1Q61644 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pacsin1Q61644 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pacsin1Q61644 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pacsin1Q61644 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pacsin1Q61644 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pacsin1Q61644 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pacsin1Q61644 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pacsin1Q61644 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pacsin1Q61644 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pacsin1Q61644 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pacsin1Q61644 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pacsin1Q61644 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pacsin1Q61644 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pacsin1Q61644 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pacsin1Q61644 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Pacsin1Q61644 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pacsin1Q61644 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Pacsin1Q61644 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pacsin1Q61644 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pacsin1Q61644 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Pacsin1Q61644 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pacsin1Q61644 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pacsin1Q61644 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pacsin1Q61644 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pacsin1Q61644 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pacsin1Q61644 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pacsin1Q61644 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pacsin1Q61644 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pacsin1Q61644 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pacsin1Q61644 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pacsin1Q61644 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pacsin1Q61644 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pacsin1Q61644 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pacsin1Q61644 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pacsin1Q61644 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pacsin1Q61644 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms