Protein–RNA interactions for Protein: Q61626

Grik5, Glutamate receptor ionotropic, kainate 5, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik5Q61626 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Grik5Q61626 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Grik5Q61626 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Grik5Q61626 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Grik5Q61626 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Grik5Q61626 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Grik5Q61626 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Grik5Q61626 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Grik5Q61626 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Grik5Q61626 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Grik5Q61626 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Grik5Q61626 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Grik5Q61626 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Grik5Q61626 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Grik5Q61626 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Grik5Q61626 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Grik5Q61626 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Grik5Q61626 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Grik5Q61626 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Grik5Q61626 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Grik5Q61626 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Grik5Q61626 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Grik5Q61626 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Grik5Q61626 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Grik5Q61626 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Grik5Q61626 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Grik5Q61626 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Grik5Q61626 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Grik5Q61626 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Grik5Q61626 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Grik5Q61626 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Grik5Q61626 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Grik5Q61626 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Grik5Q61626 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Grik5Q61626 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Grik5Q61626 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Grik5Q61626 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Grik5Q61626 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Grik5Q61626 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Grik5Q61626 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Grik5Q61626 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Grik5Q61626 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Grik5Q61626 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Grik5Q61626 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Grik5Q61626 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Grik5Q61626 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Grik5Q61626 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Grik5Q61626 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Grik5Q61626 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Grik5Q61626 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Grik5Q61626 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Grik5Q61626 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Grik5Q61626 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Grik5Q61626 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Grik5Q61626 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Grik5Q61626 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Grik5Q61626 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Grik5Q61626 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Grik5Q61626 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Grik5Q61626 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Grik5Q61626 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Grik5Q61626 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Grik5Q61626 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Grik5Q61626 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Grik5Q61626 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Grik5Q61626 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Grik5Q61626 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Grik5Q61626 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Grik5Q61626 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Grik5Q61626 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Grik5Q61626 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Grik5Q61626 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Grik5Q61626 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Grik5Q61626 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Grik5Q61626 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Grik5Q61626 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Grik5Q61626 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Grik5Q61626 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Grik5Q61626 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Grik5Q61626 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Grik5Q61626 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Grik5Q61626 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Grik5Q61626 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Grik5Q61626 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Grik5Q61626 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Grik5Q61626 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Grik5Q61626 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Grik5Q61626 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Grik5Q61626 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Grik5Q61626 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Grik5Q61626 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Grik5Q61626 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Grik5Q61626 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Grik5Q61626 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Grik5Q61626 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Grik5Q61626 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Grik5Q61626 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Grik5Q61626 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Grik5Q61626 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Grik5Q61626 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 118.8 ms