Protein–RNA interactions for Protein: Q61501

E2f1, Transcription factor E2F1, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2f1Q61501 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
E2f1Q61501 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
E2f1Q61501 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
E2f1Q61501 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
E2f1Q61501 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
E2f1Q61501 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
E2f1Q61501 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
E2f1Q61501 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
E2f1Q61501 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
E2f1Q61501 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
E2f1Q61501 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
E2f1Q61501 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
E2f1Q61501 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
E2f1Q61501 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
E2f1Q61501 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
E2f1Q61501 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
E2f1Q61501 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
E2f1Q61501 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
E2f1Q61501 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
E2f1Q61501 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
E2f1Q61501 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
E2f1Q61501 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
E2f1Q61501 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
E2f1Q61501 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
E2f1Q61501 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
E2f1Q61501 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
E2f1Q61501 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
E2f1Q61501 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
E2f1Q61501 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
E2f1Q61501 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
E2f1Q61501 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
E2f1Q61501 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
E2f1Q61501 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
E2f1Q61501 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
E2f1Q61501 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
E2f1Q61501 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
E2f1Q61501 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
E2f1Q61501 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
E2f1Q61501 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
E2f1Q61501 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
E2f1Q61501 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
E2f1Q61501 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
E2f1Q61501 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
E2f1Q61501 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
E2f1Q61501 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
E2f1Q61501 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
E2f1Q61501 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
E2f1Q61501 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
E2f1Q61501 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
E2f1Q61501 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
E2f1Q61501 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
E2f1Q61501 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
E2f1Q61501 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
E2f1Q61501 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
E2f1Q61501 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
E2f1Q61501 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
E2f1Q61501 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
E2f1Q61501 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
E2f1Q61501 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
E2f1Q61501 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
E2f1Q61501 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
E2f1Q61501 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
E2f1Q61501 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
E2f1Q61501 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
E2f1Q61501 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
E2f1Q61501 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
E2f1Q61501 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
E2f1Q61501 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
E2f1Q61501 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
E2f1Q61501 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
E2f1Q61501 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
E2f1Q61501 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
E2f1Q61501 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
E2f1Q61501 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
E2f1Q61501 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
E2f1Q61501 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
E2f1Q61501 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
E2f1Q61501 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
E2f1Q61501 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
E2f1Q61501 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
E2f1Q61501 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
E2f1Q61501 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
E2f1Q61501 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
E2f1Q61501 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
E2f1Q61501 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
E2f1Q61501 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
E2f1Q61501 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
E2f1Q61501 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
E2f1Q61501 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
E2f1Q61501 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
E2f1Q61501 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
E2f1Q61501 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
E2f1Q61501 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
E2f1Q61501 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
E2f1Q61501 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
E2f1Q61501 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
E2f1Q61501 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
E2f1Q61501 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
E2f1Q61501 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
E2f1Q61501 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms