Protein–RNA interactions for Protein: Q61345

Foxd1, Forkhead box protein D1, mousemouse

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd1Q61345 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Foxd1Q61345 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Foxd1Q61345 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Foxd1Q61345 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Foxd1Q61345 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Foxd1Q61345 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Foxd1Q61345 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Foxd1Q61345 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Foxd1Q61345 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Foxd1Q61345 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Foxd1Q61345 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Foxd1Q61345 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Foxd1Q61345 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Foxd1Q61345 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Foxd1Q61345 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Foxd1Q61345 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Foxd1Q61345 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Foxd1Q61345 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Foxd1Q61345 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Foxd1Q61345 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Foxd1Q61345 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Foxd1Q61345 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Foxd1Q61345 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Foxd1Q61345 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Foxd1Q61345 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Foxd1Q61345 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Foxd1Q61345 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Foxd1Q61345 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Foxd1Q61345 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Foxd1Q61345 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Foxd1Q61345 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Foxd1Q61345 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Foxd1Q61345 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Foxd1Q61345 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Foxd1Q61345 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Foxd1Q61345 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Foxd1Q61345 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Foxd1Q61345 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Foxd1Q61345 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Foxd1Q61345 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Foxd1Q61345 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Foxd1Q61345 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Foxd1Q61345 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Foxd1Q61345 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Foxd1Q61345 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Foxd1Q61345 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Foxd1Q61345 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Foxd1Q61345 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Foxd1Q61345 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Foxd1Q61345 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Foxd1Q61345 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Foxd1Q61345 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Foxd1Q61345 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Foxd1Q61345 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Foxd1Q61345 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Foxd1Q61345 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Foxd1Q61345 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Foxd1Q61345 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Foxd1Q61345 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Foxd1Q61345 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Foxd1Q61345 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Foxd1Q61345 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Foxd1Q61345 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Foxd1Q61345 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Foxd1Q61345 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Foxd1Q61345 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Foxd1Q61345 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Foxd1Q61345 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Foxd1Q61345 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Foxd1Q61345 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Foxd1Q61345 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Foxd1Q61345 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Foxd1Q61345 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Foxd1Q61345 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Foxd1Q61345 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Foxd1Q61345 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Foxd1Q61345 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Foxd1Q61345 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Foxd1Q61345 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Foxd1Q61345 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Foxd1Q61345 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Foxd1Q61345 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Foxd1Q61345 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Foxd1Q61345 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Foxd1Q61345 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Foxd1Q61345 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Foxd1Q61345 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Foxd1Q61345 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Foxd1Q61345 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Foxd1Q61345 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Foxd1Q61345 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Foxd1Q61345 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Foxd1Q61345 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Foxd1Q61345 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Foxd1Q61345 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Foxd1Q61345 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Foxd1Q61345 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Foxd1Q61345 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Foxd1Q61345 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Foxd1Q61345 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms