Protein–RNA interactions for Protein: Q61147

Cp, Ceruloplasmin, mousemouse

Predictions only

Length 1,061 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CpQ61147 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CpQ61147 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CpQ61147 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CpQ61147 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CpQ61147 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CpQ61147 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CpQ61147 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CpQ61147 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CpQ61147 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CpQ61147 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CpQ61147 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CpQ61147 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CpQ61147 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CpQ61147 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CpQ61147 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CpQ61147 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CpQ61147 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CpQ61147 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CpQ61147 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CpQ61147 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CpQ61147 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CpQ61147 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CpQ61147 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CpQ61147 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CpQ61147 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CpQ61147 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CpQ61147 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CpQ61147 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CpQ61147 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CpQ61147 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CpQ61147 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CpQ61147 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CpQ61147 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CpQ61147 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CpQ61147 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CpQ61147 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CpQ61147 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CpQ61147 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CpQ61147 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CpQ61147 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CpQ61147 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CpQ61147 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CpQ61147 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CpQ61147 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CpQ61147 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CpQ61147 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CpQ61147 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CpQ61147 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CpQ61147 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CpQ61147 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CpQ61147 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CpQ61147 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CpQ61147 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CpQ61147 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CpQ61147 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CpQ61147 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CpQ61147 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CpQ61147 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CpQ61147 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CpQ61147 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CpQ61147 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CpQ61147 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CpQ61147 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CpQ61147 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CpQ61147 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CpQ61147 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CpQ61147 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CpQ61147 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CpQ61147 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CpQ61147 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CpQ61147 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CpQ61147 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CpQ61147 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CpQ61147 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CpQ61147 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CpQ61147 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CpQ61147 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CpQ61147 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CpQ61147 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CpQ61147 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CpQ61147 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CpQ61147 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CpQ61147 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CpQ61147 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CpQ61147 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CpQ61147 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CpQ61147 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CpQ61147 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CpQ61147 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CpQ61147 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CpQ61147 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CpQ61147 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CpQ61147 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CpQ61147 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CpQ61147 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CpQ61147 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CpQ61147 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CpQ61147 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CpQ61147 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CpQ61147 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.5 ms