Protein–RNA interactions for Protein: Q61068

Usp17la, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein A, mousemouse

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp17laQ61068 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Usp17laQ61068 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Usp17laQ61068 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Usp17laQ61068 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Usp17laQ61068 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Usp17laQ61068 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Usp17laQ61068 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Usp17laQ61068 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Usp17laQ61068 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Usp17laQ61068 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Usp17laQ61068 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Usp17laQ61068 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Usp17laQ61068 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Usp17laQ61068 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Usp17laQ61068 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Usp17laQ61068 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Usp17laQ61068 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Usp17laQ61068 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Usp17laQ61068 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Usp17laQ61068 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Usp17laQ61068 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Usp17laQ61068 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Usp17laQ61068 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
Usp17laQ61068 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Usp17laQ61068 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Usp17laQ61068 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Usp17laQ61068 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Usp17laQ61068 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Usp17laQ61068 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Usp17laQ61068 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Usp17laQ61068 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Usp17laQ61068 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Usp17laQ61068 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Usp17laQ61068 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Usp17laQ61068 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Usp17laQ61068 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Usp17laQ61068 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Usp17laQ61068 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Usp17laQ61068 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Usp17laQ61068 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Usp17laQ61068 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Usp17laQ61068 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Usp17laQ61068 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Usp17laQ61068 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Usp17laQ61068 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Usp17laQ61068 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Usp17laQ61068 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Usp17laQ61068 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Usp17laQ61068 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Usp17laQ61068 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Usp17laQ61068 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Usp17laQ61068 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Usp17laQ61068 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Usp17laQ61068 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Usp17laQ61068 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Usp17laQ61068 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Usp17laQ61068 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Usp17laQ61068 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Usp17laQ61068 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Usp17laQ61068 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Usp17laQ61068 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Usp17laQ61068 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Usp17laQ61068 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Usp17laQ61068 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Usp17laQ61068 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Usp17laQ61068 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Usp17laQ61068 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Usp17laQ61068 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Usp17laQ61068 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Usp17laQ61068 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Usp17laQ61068 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Usp17laQ61068 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Usp17laQ61068 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Usp17laQ61068 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Usp17laQ61068 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Usp17laQ61068 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Usp17laQ61068 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Usp17laQ61068 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Usp17laQ61068 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Usp17laQ61068 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Usp17laQ61068 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Usp17laQ61068 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Usp17laQ61068 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Usp17laQ61068 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Usp17laQ61068 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Usp17laQ61068 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Usp17laQ61068 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Usp17laQ61068 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Usp17laQ61068 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Usp17laQ61068 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Usp17laQ61068 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Usp17laQ61068 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Usp17laQ61068 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Usp17laQ61068 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Usp17laQ61068 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Usp17laQ61068 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Usp17laQ61068 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Usp17laQ61068 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Usp17laQ61068 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Usp17laQ61068 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.9 ms