Protein–RNA interactions for Protein: Q61043

Nin, Ninein, mousemouse

Predictions only

Length 2,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NinQ61043 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NinQ61043 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NinQ61043 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NinQ61043 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
NinQ61043 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NinQ61043 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NinQ61043 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NinQ61043 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NinQ61043 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
NinQ61043 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NinQ61043 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NinQ61043 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NinQ61043 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
NinQ61043 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NinQ61043 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NinQ61043 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NinQ61043 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NinQ61043 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NinQ61043 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NinQ61043 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NinQ61043 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NinQ61043 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NinQ61043 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NinQ61043 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NinQ61043 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
NinQ61043 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
NinQ61043 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
NinQ61043 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NinQ61043 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NinQ61043 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NinQ61043 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NinQ61043 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NinQ61043 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NinQ61043 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NinQ61043 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
NinQ61043 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.91
NinQ61043 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
NinQ61043 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
NinQ61043 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NinQ61043 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NinQ61043 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
NinQ61043 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NinQ61043 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
NinQ61043 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NinQ61043 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NinQ61043 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NinQ61043 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
NinQ61043 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
NinQ61043 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NinQ61043 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
NinQ61043 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
NinQ61043 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
NinQ61043 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NinQ61043 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NinQ61043 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
NinQ61043 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
NinQ61043 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
NinQ61043 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC26.89■■□□□ 1.89
NinQ61043 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
NinQ61043 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
NinQ61043 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NinQ61043 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NinQ61043 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NinQ61043 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
NinQ61043 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NinQ61043 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NinQ61043 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
NinQ61043 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NinQ61043 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NinQ61043 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NinQ61043 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NinQ61043 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NinQ61043 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NinQ61043 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NinQ61043 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NinQ61043 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NinQ61043 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
NinQ61043 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
NinQ61043 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NinQ61043 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NinQ61043 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NinQ61043 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NinQ61043 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NinQ61043 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NinQ61043 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NinQ61043 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NinQ61043 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NinQ61043 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NinQ61043 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NinQ61043 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NinQ61043 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NinQ61043 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NinQ61043 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NinQ61043 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NinQ61043 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
NinQ61043 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NinQ61043 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NinQ61043 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NinQ61043 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NinQ61043 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.9 ms