Protein–RNA interactions for Protein: Q60961

Laptm4a, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Laptm4aQ60961 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Laptm4aQ60961 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Laptm4aQ60961 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Laptm4aQ60961 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Laptm4aQ60961 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Laptm4aQ60961 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Laptm4aQ60961 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Laptm4aQ60961 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Laptm4aQ60961 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Laptm4aQ60961 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Laptm4aQ60961 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Laptm4aQ60961 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Laptm4aQ60961 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Laptm4aQ60961 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Laptm4aQ60961 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Laptm4aQ60961 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Laptm4aQ60961 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Laptm4aQ60961 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Laptm4aQ60961 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Laptm4aQ60961 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Laptm4aQ60961 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Laptm4aQ60961 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Laptm4aQ60961 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Laptm4aQ60961 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Laptm4aQ60961 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Laptm4aQ60961 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Laptm4aQ60961 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Laptm4aQ60961 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Laptm4aQ60961 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Laptm4aQ60961 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Laptm4aQ60961 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Laptm4aQ60961 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Laptm4aQ60961 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Laptm4aQ60961 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Laptm4aQ60961 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Laptm4aQ60961 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Laptm4aQ60961 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Laptm4aQ60961 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Laptm4aQ60961 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Laptm4aQ60961 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Laptm4aQ60961 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Laptm4aQ60961 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Laptm4aQ60961 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Laptm4aQ60961 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Laptm4aQ60961 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Laptm4aQ60961 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Laptm4aQ60961 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Laptm4aQ60961 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Laptm4aQ60961 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Laptm4aQ60961 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Laptm4aQ60961 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Laptm4aQ60961 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Laptm4aQ60961 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Laptm4aQ60961 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Laptm4aQ60961 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Laptm4aQ60961 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Laptm4aQ60961 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Laptm4aQ60961 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Laptm4aQ60961 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Laptm4aQ60961 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Laptm4aQ60961 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Laptm4aQ60961 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Laptm4aQ60961 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Laptm4aQ60961 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Laptm4aQ60961 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Laptm4aQ60961 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Laptm4aQ60961 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Laptm4aQ60961 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Laptm4aQ60961 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Laptm4aQ60961 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Laptm4aQ60961 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Laptm4aQ60961 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Laptm4aQ60961 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Laptm4aQ60961 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Laptm4aQ60961 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Laptm4aQ60961 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Laptm4aQ60961 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Laptm4aQ60961 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Laptm4aQ60961 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Laptm4aQ60961 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Laptm4aQ60961 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Laptm4aQ60961 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Laptm4aQ60961 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Laptm4aQ60961 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Laptm4aQ60961 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Laptm4aQ60961 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Laptm4aQ60961 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Laptm4aQ60961 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Laptm4aQ60961 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Laptm4aQ60961 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Laptm4aQ60961 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Laptm4aQ60961 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Laptm4aQ60961 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Laptm4aQ60961 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Laptm4aQ60961 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Laptm4aQ60961 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Laptm4aQ60961 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Laptm4aQ60961 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Laptm4aQ60961 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Laptm4aQ60961 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.3 ms