Protein–RNA interactions for Protein: Q60803

Traf3, TNF receptor-associated factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3Q60803 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Traf3Q60803 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Traf3Q60803 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Traf3Q60803 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Traf3Q60803 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Traf3Q60803 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Traf3Q60803 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Traf3Q60803 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Traf3Q60803 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Traf3Q60803 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Traf3Q60803 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Traf3Q60803 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Traf3Q60803 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Traf3Q60803 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Traf3Q60803 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Traf3Q60803 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Traf3Q60803 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Traf3Q60803 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Traf3Q60803 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Traf3Q60803 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Traf3Q60803 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Traf3Q60803 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Traf3Q60803 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Traf3Q60803 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Traf3Q60803 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Traf3Q60803 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Traf3Q60803 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Traf3Q60803 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Traf3Q60803 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Traf3Q60803 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Traf3Q60803 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Traf3Q60803 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Traf3Q60803 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Traf3Q60803 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Traf3Q60803 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Traf3Q60803 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Traf3Q60803 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Traf3Q60803 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Traf3Q60803 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Traf3Q60803 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Traf3Q60803 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Traf3Q60803 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Traf3Q60803 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Traf3Q60803 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Traf3Q60803 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Traf3Q60803 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Traf3Q60803 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Traf3Q60803 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Traf3Q60803 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Traf3Q60803 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Traf3Q60803 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Traf3Q60803 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Traf3Q60803 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Traf3Q60803 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Traf3Q60803 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Traf3Q60803 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Traf3Q60803 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Traf3Q60803 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Traf3Q60803 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Traf3Q60803 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Traf3Q60803 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Traf3Q60803 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Traf3Q60803 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Traf3Q60803 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Traf3Q60803 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Traf3Q60803 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Traf3Q60803 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Traf3Q60803 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
Traf3Q60803 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Traf3Q60803 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Traf3Q60803 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Traf3Q60803 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Traf3Q60803 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Traf3Q60803 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Traf3Q60803 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Traf3Q60803 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Traf3Q60803 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Traf3Q60803 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Traf3Q60803 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Traf3Q60803 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Traf3Q60803 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Traf3Q60803 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Traf3Q60803 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Traf3Q60803 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Traf3Q60803 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Traf3Q60803 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Traf3Q60803 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Traf3Q60803 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Traf3Q60803 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Traf3Q60803 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Traf3Q60803 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Traf3Q60803 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Traf3Q60803 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Traf3Q60803 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Traf3Q60803 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Traf3Q60803 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Traf3Q60803 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Traf3Q60803 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Traf3Q60803 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Traf3Q60803 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.9 ms