Protein–RNA interactions for Protein: Q60753

Ctf1, Cardiotrophin-1, mousemouse

Predictions only

Length 203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctf1Q60753 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ctf1Q60753 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ctf1Q60753 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ctf1Q60753 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ctf1Q60753 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ctf1Q60753 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ctf1Q60753 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ctf1Q60753 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ctf1Q60753 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ctf1Q60753 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ctf1Q60753 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ctf1Q60753 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ctf1Q60753 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ctf1Q60753 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ctf1Q60753 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ctf1Q60753 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ctf1Q60753 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ctf1Q60753 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ctf1Q60753 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ctf1Q60753 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Ctf1Q60753 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ctf1Q60753 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ctf1Q60753 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ctf1Q60753 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ctf1Q60753 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ctf1Q60753 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ctf1Q60753 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ctf1Q60753 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ctf1Q60753 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ctf1Q60753 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ctf1Q60753 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ctf1Q60753 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ctf1Q60753 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ctf1Q60753 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ctf1Q60753 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ctf1Q60753 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ctf1Q60753 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ctf1Q60753 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ctf1Q60753 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ctf1Q60753 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ctf1Q60753 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ctf1Q60753 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ctf1Q60753 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ctf1Q60753 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ctf1Q60753 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ctf1Q60753 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ctf1Q60753 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ctf1Q60753 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ctf1Q60753 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ctf1Q60753 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ctf1Q60753 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ctf1Q60753 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ctf1Q60753 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ctf1Q60753 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ctf1Q60753 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ctf1Q60753 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ctf1Q60753 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ctf1Q60753 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ctf1Q60753 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ctf1Q60753 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Ctf1Q60753 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ctf1Q60753 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ctf1Q60753 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ctf1Q60753 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ctf1Q60753 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ctf1Q60753 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Ctf1Q60753 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ctf1Q60753 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ctf1Q60753 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Ctf1Q60753 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ctf1Q60753 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ctf1Q60753 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ctf1Q60753 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ctf1Q60753 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ctf1Q60753 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ctf1Q60753 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ctf1Q60753 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ctf1Q60753 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Ctf1Q60753 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ctf1Q60753 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ctf1Q60753 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ctf1Q60753 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ctf1Q60753 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ctf1Q60753 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ctf1Q60753 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Ctf1Q60753 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ctf1Q60753 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ctf1Q60753 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ctf1Q60753 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ctf1Q60753 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ctf1Q60753 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ctf1Q60753 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ctf1Q60753 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ctf1Q60753 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ctf1Q60753 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ctf1Q60753 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ctf1Q60753 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ctf1Q60753 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ctf1Q60753 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ctf1Q60753 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms