Protein–RNA interactions for Protein: Q60737

Csnk2a1, Casein kinase II subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk2a1Q60737 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Csnk2a1Q60737 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Csnk2a1Q60737 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Csnk2a1Q60737 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Csnk2a1Q60737 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Csnk2a1Q60737 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Csnk2a1Q60737 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Csnk2a1Q60737 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Csnk2a1Q60737 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Csnk2a1Q60737 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Csnk2a1Q60737 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Csnk2a1Q60737 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Csnk2a1Q60737 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Csnk2a1Q60737 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Csnk2a1Q60737 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Csnk2a1Q60737 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Csnk2a1Q60737 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Csnk2a1Q60737 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Csnk2a1Q60737 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Csnk2a1Q60737 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Csnk2a1Q60737 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Csnk2a1Q60737 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Csnk2a1Q60737 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Csnk2a1Q60737 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Csnk2a1Q60737 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Csnk2a1Q60737 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Csnk2a1Q60737 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Csnk2a1Q60737 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Csnk2a1Q60737 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Csnk2a1Q60737 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Csnk2a1Q60737 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Csnk2a1Q60737 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Csnk2a1Q60737 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Csnk2a1Q60737 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Csnk2a1Q60737 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Csnk2a1Q60737 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Csnk2a1Q60737 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Csnk2a1Q60737 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Csnk2a1Q60737 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Csnk2a1Q60737 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Csnk2a1Q60737 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Csnk2a1Q60737 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Csnk2a1Q60737 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Csnk2a1Q60737 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Csnk2a1Q60737 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Csnk2a1Q60737 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Csnk2a1Q60737 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Csnk2a1Q60737 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Csnk2a1Q60737 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Csnk2a1Q60737 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Csnk2a1Q60737 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Csnk2a1Q60737 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Csnk2a1Q60737 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Csnk2a1Q60737 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Csnk2a1Q60737 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Csnk2a1Q60737 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Csnk2a1Q60737 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Csnk2a1Q60737 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Csnk2a1Q60737 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Csnk2a1Q60737 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Csnk2a1Q60737 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Csnk2a1Q60737 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Csnk2a1Q60737 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Csnk2a1Q60737 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Csnk2a1Q60737 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Csnk2a1Q60737 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Csnk2a1Q60737 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Csnk2a1Q60737 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Csnk2a1Q60737 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Csnk2a1Q60737 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Csnk2a1Q60737 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Csnk2a1Q60737 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Csnk2a1Q60737 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Csnk2a1Q60737 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Csnk2a1Q60737 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Csnk2a1Q60737 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Csnk2a1Q60737 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Csnk2a1Q60737 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Csnk2a1Q60737 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Csnk2a1Q60737 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Csnk2a1Q60737 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Csnk2a1Q60737 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Csnk2a1Q60737 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Csnk2a1Q60737 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Csnk2a1Q60737 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Csnk2a1Q60737 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Csnk2a1Q60737 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Csnk2a1Q60737 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Csnk2a1Q60737 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Csnk2a1Q60737 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Csnk2a1Q60737 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Csnk2a1Q60737 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Csnk2a1Q60737 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Csnk2a1Q60737 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Csnk2a1Q60737 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Csnk2a1Q60737 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Csnk2a1Q60737 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Csnk2a1Q60737 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Csnk2a1Q60737 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Csnk2a1Q60737 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.6 ms