Protein–RNA interactions for Protein: Q60677

Itgae, Integrin alpha-E, mousemouse

Predictions only

Length 1,167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ItgaeQ60677 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ItgaeQ60677 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ItgaeQ60677 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ItgaeQ60677 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ItgaeQ60677 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ItgaeQ60677 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ItgaeQ60677 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ItgaeQ60677 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ItgaeQ60677 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ItgaeQ60677 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ItgaeQ60677 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ItgaeQ60677 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ItgaeQ60677 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ItgaeQ60677 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
ItgaeQ60677 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
ItgaeQ60677 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ItgaeQ60677 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ItgaeQ60677 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ItgaeQ60677 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ItgaeQ60677 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
ItgaeQ60677 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
ItgaeQ60677 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ItgaeQ60677 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ItgaeQ60677 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ItgaeQ60677 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ItgaeQ60677 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ItgaeQ60677 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ItgaeQ60677 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ItgaeQ60677 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ItgaeQ60677 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ItgaeQ60677 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ItgaeQ60677 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ItgaeQ60677 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ItgaeQ60677 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ItgaeQ60677 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
ItgaeQ60677 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ItgaeQ60677 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ItgaeQ60677 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ItgaeQ60677 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ItgaeQ60677 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ItgaeQ60677 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ItgaeQ60677 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ItgaeQ60677 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ItgaeQ60677 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ItgaeQ60677 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ItgaeQ60677 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ItgaeQ60677 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.51
ItgaeQ60677 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
ItgaeQ60677 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ItgaeQ60677 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ItgaeQ60677 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ItgaeQ60677 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ItgaeQ60677 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ItgaeQ60677 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ItgaeQ60677 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ItgaeQ60677 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ItgaeQ60677 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ItgaeQ60677 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
ItgaeQ60677 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ItgaeQ60677 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ItgaeQ60677 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ItgaeQ60677 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ItgaeQ60677 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ItgaeQ60677 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
ItgaeQ60677 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ItgaeQ60677 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ItgaeQ60677 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ItgaeQ60677 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ItgaeQ60677 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ItgaeQ60677 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ItgaeQ60677 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ItgaeQ60677 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
ItgaeQ60677 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
ItgaeQ60677 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ItgaeQ60677 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ItgaeQ60677 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ItgaeQ60677 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ItgaeQ60677 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ItgaeQ60677 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ItgaeQ60677 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ItgaeQ60677 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
ItgaeQ60677 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ItgaeQ60677 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ItgaeQ60677 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ItgaeQ60677 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ItgaeQ60677 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ItgaeQ60677 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ItgaeQ60677 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ItgaeQ60677 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ItgaeQ60677 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ItgaeQ60677 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
ItgaeQ60677 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ItgaeQ60677 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ItgaeQ60677 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ItgaeQ60677 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ItgaeQ60677 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ItgaeQ60677 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ItgaeQ60677 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ItgaeQ60677 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ItgaeQ60677 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms