Protein–RNA interactions for Protein: Q60520

Sin3a, Paired amphipathic helix protein Sin3a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3aQ60520 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC31.48■■■□□ 2.63
Sin3aQ60520 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
Sin3aQ60520 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC31.47■■■□□ 2.63
Sin3aQ60520 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
Sin3aQ60520 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC31.47■■■□□ 2.63
Sin3aQ60520 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
Sin3aQ60520 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
Sin3aQ60520 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
Sin3aQ60520 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
Sin3aQ60520 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
Sin3aQ60520 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC31.45■■■□□ 2.63
Sin3aQ60520 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
Sin3aQ60520 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
Sin3aQ60520 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC31.45■■■□□ 2.63
Sin3aQ60520 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
Sin3aQ60520 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.44■■■□□ 2.62
Sin3aQ60520 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC31.44■■■□□ 2.62
Sin3aQ60520 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
Sin3aQ60520 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
Sin3aQ60520 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
Sin3aQ60520 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
Sin3aQ60520 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
Sin3aQ60520 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC31.43■■■□□ 2.62
Sin3aQ60520 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
Sin3aQ60520 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
Sin3aQ60520 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
Sin3aQ60520 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC31.42■■■□□ 2.62
Sin3aQ60520 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC31.42■■■□□ 2.62
Sin3aQ60520 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC31.42■■■□□ 2.62
Sin3aQ60520 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC31.41■■■□□ 2.62
Sin3aQ60520 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC31.41■■■□□ 2.62
Sin3aQ60520 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
Sin3aQ60520 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
Sin3aQ60520 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.41■■■□□ 2.62
Sin3aQ60520 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC31.41■■■□□ 2.62
Sin3aQ60520 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
Sin3aQ60520 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
Sin3aQ60520 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
Sin3aQ60520 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
Sin3aQ60520 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
Sin3aQ60520 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC31.39■■■□□ 2.62
Sin3aQ60520 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
Sin3aQ60520 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.39■■■□□ 2.61
Sin3aQ60520 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.61
Sin3aQ60520 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
Sin3aQ60520 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
Sin3aQ60520 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
Sin3aQ60520 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
Sin3aQ60520 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
Sin3aQ60520 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.36■■■□□ 2.61
Sin3aQ60520 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC31.36■■■□□ 2.61
Sin3aQ60520 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
Sin3aQ60520 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
Sin3aQ60520 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC31.35■■■□□ 2.61
Sin3aQ60520 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
Sin3aQ60520 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC31.35■■■□□ 2.61
Sin3aQ60520 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
Sin3aQ60520 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
Sin3aQ60520 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Sin3aQ60520 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
Sin3aQ60520 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
Sin3aQ60520 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
Sin3aQ60520 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
Sin3aQ60520 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
Sin3aQ60520 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
Sin3aQ60520 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC31.3■■■□□ 2.6
Sin3aQ60520 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC31.3■■■□□ 2.6
Sin3aQ60520 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
Sin3aQ60520 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
Sin3aQ60520 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC31.3■■■□□ 2.6
Sin3aQ60520 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
Sin3aQ60520 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
Sin3aQ60520 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC31.29■■■□□ 2.6
Sin3aQ60520 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
Sin3aQ60520 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.27■■■□□ 2.6
Sin3aQ60520 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
Sin3aQ60520 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
Sin3aQ60520 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC31.26■■■□□ 2.59
Sin3aQ60520 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC31.26■■■□□ 2.59
Sin3aQ60520 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
Sin3aQ60520 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
Sin3aQ60520 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
Sin3aQ60520 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Sin3aQ60520 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Sin3aQ60520 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
Sin3aQ60520 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
Sin3aQ60520 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.23■■■□□ 2.59
Sin3aQ60520 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
Sin3aQ60520 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
Sin3aQ60520 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.22■■■□□ 2.59
Sin3aQ60520 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
Sin3aQ60520 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC31.22■■■□□ 2.59
Sin3aQ60520 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC31.22■■■□□ 2.59
Sin3aQ60520 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC31.21■■■□□ 2.59
Sin3aQ60520 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Sin3aQ60520 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Sin3aQ60520 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC31.2■■■□□ 2.59
Sin3aQ60520 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC31.2■■■□□ 2.59
Sin3aQ60520 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
Sin3aQ60520 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC31.2■■■□□ 2.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms