Protein–RNA interactions for Protein: Q5YIR8

Clec4a4, C-type lectin domain family 4, member a4, mousemouse

Predictions only

Length 236 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec4a4Q5YIR8 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Clec4a4Q5YIR8 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Clec4a4Q5YIR8 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Clec4a4Q5YIR8 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Clec4a4Q5YIR8 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Clec4a4Q5YIR8 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Clec4a4Q5YIR8 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Clec4a4Q5YIR8 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Clec4a4Q5YIR8 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Clec4a4Q5YIR8 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Clec4a4Q5YIR8 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Clec4a4Q5YIR8 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Clec4a4Q5YIR8 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Clec4a4Q5YIR8 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Clec4a4Q5YIR8 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Clec4a4Q5YIR8 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Clec4a4Q5YIR8 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Clec4a4Q5YIR8 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Clec4a4Q5YIR8 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Clec4a4Q5YIR8 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Clec4a4Q5YIR8 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Clec4a4Q5YIR8 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Clec4a4Q5YIR8 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Clec4a4Q5YIR8 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Clec4a4Q5YIR8 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Clec4a4Q5YIR8 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Clec4a4Q5YIR8 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Clec4a4Q5YIR8 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Clec4a4Q5YIR8 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Clec4a4Q5YIR8 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Clec4a4Q5YIR8 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Clec4a4Q5YIR8 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Clec4a4Q5YIR8 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Clec4a4Q5YIR8 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Clec4a4Q5YIR8 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Clec4a4Q5YIR8 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Clec4a4Q5YIR8 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Clec4a4Q5YIR8 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Clec4a4Q5YIR8 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Clec4a4Q5YIR8 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Clec4a4Q5YIR8 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Clec4a4Q5YIR8 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Clec4a4Q5YIR8 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Clec4a4Q5YIR8 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Clec4a4Q5YIR8 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Clec4a4Q5YIR8 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Clec4a4Q5YIR8 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Clec4a4Q5YIR8 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Clec4a4Q5YIR8 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Clec4a4Q5YIR8 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Clec4a4Q5YIR8 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Clec4a4Q5YIR8 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Clec4a4Q5YIR8 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Clec4a4Q5YIR8 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Clec4a4Q5YIR8 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Clec4a4Q5YIR8 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Clec4a4Q5YIR8 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Clec4a4Q5YIR8 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Clec4a4Q5YIR8 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Clec4a4Q5YIR8 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Clec4a4Q5YIR8 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Clec4a4Q5YIR8 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Clec4a4Q5YIR8 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Clec4a4Q5YIR8 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Clec4a4Q5YIR8 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Clec4a4Q5YIR8 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Clec4a4Q5YIR8 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Clec4a4Q5YIR8 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Clec4a4Q5YIR8 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Clec4a4Q5YIR8 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Clec4a4Q5YIR8 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Clec4a4Q5YIR8 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Clec4a4Q5YIR8 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Clec4a4Q5YIR8 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Clec4a4Q5YIR8 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Clec4a4Q5YIR8 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Clec4a4Q5YIR8 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Clec4a4Q5YIR8 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Clec4a4Q5YIR8 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Clec4a4Q5YIR8 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Clec4a4Q5YIR8 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Clec4a4Q5YIR8 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Clec4a4Q5YIR8 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Clec4a4Q5YIR8 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Clec4a4Q5YIR8 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Clec4a4Q5YIR8 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Clec4a4Q5YIR8 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Clec4a4Q5YIR8 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Clec4a4Q5YIR8 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Clec4a4Q5YIR8 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Clec4a4Q5YIR8 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Clec4a4Q5YIR8 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Clec4a4Q5YIR8 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Clec4a4Q5YIR8 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Clec4a4Q5YIR8 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Clec4a4Q5YIR8 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Clec4a4Q5YIR8 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Clec4a4Q5YIR8 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Clec4a4Q5YIR8 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Clec4a4Q5YIR8 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.4 ms