Protein–RNA interactions for Protein: Q5SX40

Myh1, Myosin-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,942 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myh1Q5SX40 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Myh1Q5SX40 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Myh1Q5SX40 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Myh1Q5SX40 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Myh1Q5SX40 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Myh1Q5SX40 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Myh1Q5SX40 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Myh1Q5SX40 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Myh1Q5SX40 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Myh1Q5SX40 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Myh1Q5SX40 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Myh1Q5SX40 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Myh1Q5SX40 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Myh1Q5SX40 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Myh1Q5SX40 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Myh1Q5SX40 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Myh1Q5SX40 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Myh1Q5SX40 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Myh1Q5SX40 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
Myh1Q5SX40 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Myh1Q5SX40 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
Myh1Q5SX40 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Myh1Q5SX40 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Myh1Q5SX40 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Myh1Q5SX40 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Myh1Q5SX40 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Myh1Q5SX40 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Myh1Q5SX40 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Myh1Q5SX40 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Myh1Q5SX40 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
Myh1Q5SX40 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Myh1Q5SX40 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Myh1Q5SX40 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Myh1Q5SX40 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Myh1Q5SX40 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Myh1Q5SX40 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Myh1Q5SX40 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Myh1Q5SX40 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Myh1Q5SX40 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Myh1Q5SX40 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Myh1Q5SX40 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Myh1Q5SX40 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Myh1Q5SX40 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Myh1Q5SX40 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Myh1Q5SX40 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Myh1Q5SX40 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Myh1Q5SX40 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Myh1Q5SX40 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Myh1Q5SX40 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Myh1Q5SX40 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Myh1Q5SX40 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Myh1Q5SX40 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Myh1Q5SX40 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Myh1Q5SX40 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Myh1Q5SX40 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Myh1Q5SX40 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Myh1Q5SX40 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Myh1Q5SX40 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Myh1Q5SX40 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Myh1Q5SX40 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Myh1Q5SX40 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Myh1Q5SX40 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Myh1Q5SX40 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Myh1Q5SX40 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Myh1Q5SX40 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Myh1Q5SX40 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Myh1Q5SX40 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Myh1Q5SX40 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Myh1Q5SX40 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Myh1Q5SX40 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Myh1Q5SX40 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Myh1Q5SX40 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Myh1Q5SX40 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Myh1Q5SX40 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Myh1Q5SX40 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Myh1Q5SX40 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
Myh1Q5SX40 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
Myh1Q5SX40 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Myh1Q5SX40 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Myh1Q5SX40 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Myh1Q5SX40 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Myh1Q5SX40 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Myh1Q5SX40 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Myh1Q5SX40 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Myh1Q5SX40 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Myh1Q5SX40 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Myh1Q5SX40 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
Myh1Q5SX40 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Myh1Q5SX40 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Myh1Q5SX40 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Myh1Q5SX40 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Myh1Q5SX40 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Myh1Q5SX40 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Myh1Q5SX40 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Myh1Q5SX40 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Myh1Q5SX40 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Myh1Q5SX40 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Myh1Q5SX40 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Myh1Q5SX40 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Myh1Q5SX40 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.6 ms