Protein–RNA interactions for Protein: Q5SUD9

Bbs12, Bardet-Biedl syndrome 12 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bbs12Q5SUD9 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Bbs12Q5SUD9 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Bbs12Q5SUD9 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Bbs12Q5SUD9 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Bbs12Q5SUD9 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Bbs12Q5SUD9 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Bbs12Q5SUD9 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Bbs12Q5SUD9 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Bbs12Q5SUD9 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Bbs12Q5SUD9 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Bbs12Q5SUD9 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Bbs12Q5SUD9 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Bbs12Q5SUD9 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Bbs12Q5SUD9 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Bbs12Q5SUD9 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Bbs12Q5SUD9 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Bbs12Q5SUD9 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Bbs12Q5SUD9 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Bbs12Q5SUD9 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Bbs12Q5SUD9 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Bbs12Q5SUD9 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Bbs12Q5SUD9 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Bbs12Q5SUD9 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Bbs12Q5SUD9 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Bbs12Q5SUD9 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Bbs12Q5SUD9 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Bbs12Q5SUD9 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Bbs12Q5SUD9 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Bbs12Q5SUD9 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Bbs12Q5SUD9 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Bbs12Q5SUD9 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Bbs12Q5SUD9 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Bbs12Q5SUD9 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Bbs12Q5SUD9 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Bbs12Q5SUD9 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Bbs12Q5SUD9 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Bbs12Q5SUD9 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Bbs12Q5SUD9 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Bbs12Q5SUD9 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Bbs12Q5SUD9 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Bbs12Q5SUD9 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Bbs12Q5SUD9 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Bbs12Q5SUD9 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Bbs12Q5SUD9 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Bbs12Q5SUD9 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Bbs12Q5SUD9 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Bbs12Q5SUD9 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Bbs12Q5SUD9 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Bbs12Q5SUD9 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Bbs12Q5SUD9 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Bbs12Q5SUD9 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Bbs12Q5SUD9 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Bbs12Q5SUD9 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Bbs12Q5SUD9 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Bbs12Q5SUD9 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Bbs12Q5SUD9 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Bbs12Q5SUD9 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Bbs12Q5SUD9 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Bbs12Q5SUD9 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Bbs12Q5SUD9 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Bbs12Q5SUD9 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Bbs12Q5SUD9 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Bbs12Q5SUD9 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Bbs12Q5SUD9 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Bbs12Q5SUD9 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Bbs12Q5SUD9 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Bbs12Q5SUD9 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Bbs12Q5SUD9 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Bbs12Q5SUD9 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Bbs12Q5SUD9 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Bbs12Q5SUD9 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Bbs12Q5SUD9 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Bbs12Q5SUD9 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Bbs12Q5SUD9 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Bbs12Q5SUD9 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Bbs12Q5SUD9 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Bbs12Q5SUD9 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Bbs12Q5SUD9 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Bbs12Q5SUD9 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Bbs12Q5SUD9 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Bbs12Q5SUD9 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Bbs12Q5SUD9 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Bbs12Q5SUD9 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Bbs12Q5SUD9 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Bbs12Q5SUD9 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Bbs12Q5SUD9 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Bbs12Q5SUD9 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Bbs12Q5SUD9 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Bbs12Q5SUD9 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Bbs12Q5SUD9 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Bbs12Q5SUD9 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Bbs12Q5SUD9 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Bbs12Q5SUD9 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Bbs12Q5SUD9 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Bbs12Q5SUD9 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Bbs12Q5SUD9 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Bbs12Q5SUD9 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Bbs12Q5SUD9 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Bbs12Q5SUD9 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Bbs12Q5SUD9 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms