Protein–RNA interactions for Protein: Q5SP85

Ccdc85a, Coiled-coil domain-containing protein 85A, mousemouse

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc85aQ5SP85 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccdc85aQ5SP85 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccdc85aQ5SP85 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccdc85aQ5SP85 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccdc85aQ5SP85 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccdc85aQ5SP85 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccdc85aQ5SP85 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccdc85aQ5SP85 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccdc85aQ5SP85 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccdc85aQ5SP85 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccdc85aQ5SP85 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccdc85aQ5SP85 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccdc85aQ5SP85 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccdc85aQ5SP85 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccdc85aQ5SP85 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccdc85aQ5SP85 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccdc85aQ5SP85 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccdc85aQ5SP85 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccdc85aQ5SP85 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccdc85aQ5SP85 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccdc85aQ5SP85 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccdc85aQ5SP85 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccdc85aQ5SP85 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccdc85aQ5SP85 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccdc85aQ5SP85 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ccdc85aQ5SP85 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ccdc85aQ5SP85 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ccdc85aQ5SP85 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccdc85aQ5SP85 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccdc85aQ5SP85 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccdc85aQ5SP85 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccdc85aQ5SP85 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccdc85aQ5SP85 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccdc85aQ5SP85 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccdc85aQ5SP85 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccdc85aQ5SP85 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccdc85aQ5SP85 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccdc85aQ5SP85 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccdc85aQ5SP85 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccdc85aQ5SP85 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccdc85aQ5SP85 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccdc85aQ5SP85 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccdc85aQ5SP85 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccdc85aQ5SP85 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccdc85aQ5SP85 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccdc85aQ5SP85 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccdc85aQ5SP85 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccdc85aQ5SP85 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ccdc85aQ5SP85 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccdc85aQ5SP85 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccdc85aQ5SP85 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccdc85aQ5SP85 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ccdc85aQ5SP85 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ccdc85aQ5SP85 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ccdc85aQ5SP85 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ccdc85aQ5SP85 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ccdc85aQ5SP85 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ccdc85aQ5SP85 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ccdc85aQ5SP85 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ccdc85aQ5SP85 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccdc85aQ5SP85 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccdc85aQ5SP85 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccdc85aQ5SP85 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccdc85aQ5SP85 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccdc85aQ5SP85 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccdc85aQ5SP85 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccdc85aQ5SP85 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccdc85aQ5SP85 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ccdc85aQ5SP85 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Ccdc85aQ5SP85 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccdc85aQ5SP85 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccdc85aQ5SP85 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccdc85aQ5SP85 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccdc85aQ5SP85 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccdc85aQ5SP85 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccdc85aQ5SP85 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccdc85aQ5SP85 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccdc85aQ5SP85 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccdc85aQ5SP85 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccdc85aQ5SP85 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccdc85aQ5SP85 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccdc85aQ5SP85 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccdc85aQ5SP85 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccdc85aQ5SP85 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccdc85aQ5SP85 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccdc85aQ5SP85 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccdc85aQ5SP85 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccdc85aQ5SP85 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccdc85aQ5SP85 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccdc85aQ5SP85 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccdc85aQ5SP85 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccdc85aQ5SP85 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccdc85aQ5SP85 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccdc85aQ5SP85 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc85aQ5SP85 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc85aQ5SP85 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc85aQ5SP85 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc85aQ5SP85 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc85aQ5SP85 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc85aQ5SP85 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms