Protein–RNA interactions for Protein: Q5R1I8

Trav3-1, T cell receptor alpha variable 3-1 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trav3-1Q5R1I8 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trav3-1Q5R1I8 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trav3-1Q5R1I8 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trav3-1Q5R1I8 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trav3-1Q5R1I8 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Trav3-1Q5R1I8 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trav3-1Q5R1I8 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trav3-1Q5R1I8 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trav3-1Q5R1I8 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trav3-1Q5R1I8 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trav3-1Q5R1I8 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trav3-1Q5R1I8 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Trav3-1Q5R1I8 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trav3-1Q5R1I8 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trav3-1Q5R1I8 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trav3-1Q5R1I8 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Trav3-1Q5R1I8 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trav3-1Q5R1I8 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trav3-1Q5R1I8 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trav3-1Q5R1I8 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trav3-1Q5R1I8 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trav3-1Q5R1I8 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trav3-1Q5R1I8 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trav3-1Q5R1I8 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trav3-1Q5R1I8 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trav3-1Q5R1I8 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trav3-1Q5R1I8 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trav3-1Q5R1I8 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trav3-1Q5R1I8 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trav3-1Q5R1I8 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trav3-1Q5R1I8 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trav3-1Q5R1I8 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trav3-1Q5R1I8 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trav3-1Q5R1I8 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trav3-1Q5R1I8 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trav3-1Q5R1I8 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trav3-1Q5R1I8 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trav3-1Q5R1I8 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trav3-1Q5R1I8 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trav3-1Q5R1I8 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trav3-1Q5R1I8 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trav3-1Q5R1I8 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trav3-1Q5R1I8 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trav3-1Q5R1I8 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trav3-1Q5R1I8 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trav3-1Q5R1I8 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trav3-1Q5R1I8 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trav3-1Q5R1I8 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trav3-1Q5R1I8 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trav3-1Q5R1I8 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trav3-1Q5R1I8 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trav3-1Q5R1I8 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trav3-1Q5R1I8 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trav3-1Q5R1I8 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trav3-1Q5R1I8 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trav3-1Q5R1I8 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trav3-1Q5R1I8 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trav3-1Q5R1I8 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trav3-1Q5R1I8 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trav3-1Q5R1I8 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trav3-1Q5R1I8 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trav3-1Q5R1I8 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trav3-1Q5R1I8 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trav3-1Q5R1I8 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trav3-1Q5R1I8 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Trav3-1Q5R1I8 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Trav3-1Q5R1I8 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trav3-1Q5R1I8 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trav3-1Q5R1I8 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trav3-1Q5R1I8 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trav3-1Q5R1I8 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trav3-1Q5R1I8 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trav3-1Q5R1I8 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trav3-1Q5R1I8 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trav3-1Q5R1I8 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trav3-1Q5R1I8 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trav3-1Q5R1I8 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trav3-1Q5R1I8 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trav3-1Q5R1I8 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trav3-1Q5R1I8 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trav3-1Q5R1I8 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trav3-1Q5R1I8 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trav3-1Q5R1I8 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trav3-1Q5R1I8 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trav3-1Q5R1I8 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trav3-1Q5R1I8 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trav3-1Q5R1I8 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trav3-1Q5R1I8 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trav3-1Q5R1I8 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trav3-1Q5R1I8 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trav3-1Q5R1I8 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Trav3-1Q5R1I8 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trav3-1Q5R1I8 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trav3-1Q5R1I8 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trav3-1Q5R1I8 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trav3-1Q5R1I8 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trav3-1Q5R1I8 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trav3-1Q5R1I8 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trav3-1Q5R1I8 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trav3-1Q5R1I8 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms